宫颈囊肿可由生理性和病理性原因引起。生理性原因是女性生理周期中新生鳞状上皮覆盖宫颈腺管开口致分泌物潴留；病理性原因包括慢性炎症刺激使宫颈腺管周围结缔组织增生压迫腺管致分泌物积聚，以及宫颈腺管因宫颈局部损伤等因素堵塞使分泌物潴留。各年龄段女性均可患病，生育期、性生活活跃育龄女性及有妇科炎症病史、宫腔操作史或分娩史女性相对更易出现相关情况。
一、生理性原因
（一）鳞状上皮覆盖宫颈腺管开口
1.正常生理过程中的上皮覆盖：在女性的生理周期中，宫颈部位的鳞状上皮会有正常的生长和更替情况。当新生的鳞状上皮覆盖宫颈腺管开口时，会导致腺管内的分泌物引流受阻，进而潴留形成囊肿。这种情况在各年龄段有正常生理变化的女性中都可能出现，尤其在生育期女性中较为常见，因为此阶段女性的宫颈上皮代谢相对活跃。
二、病理性原因
（一）慢性炎症刺激
1.炎症对宫颈腺体的影响：长期的慢性宫颈炎，如宫颈部位受到细菌、病毒等病原体感染引发炎症反应，会使宫颈腺管周围的结缔组织增生。增生的结缔组织会压迫宫颈腺管，阻碍腺管的正常引流，使得腺体内的分泌物积聚，从而形成囊肿。这种情况在有妇科炎症病史的女性中更易发生，比如既往有不洁性生活史、多次妇科操作史等导致宫颈反复炎症的女性。不同年龄的女性都可能因慢性炎症刺激患病，但性生活活跃的育龄女性相对风险更高。
（二）宫颈腺管堵塞
1.多种因素导致的腺管堵塞：除了上述的鳞状上皮覆盖和慢性炎症刺激外，一些其他因素也可能导致宫颈腺管堵塞。例如宫颈局部的损伤，如分娩时的宫颈裂伤、人工流产手术等造成的宫颈损伤，可能会影响宫颈腺管的正常结构，导致腺管堵塞，进而使分泌物潴留形成囊肿。不同年龄的女性都可能因宫颈损伤而引发宫颈囊肿，尤其是有过宫腔操作史或分娩史的女性风险相对增加。
