真菌性角膜炎与细菌性角膜炎在病因、临床表现、实验室检查有差异，前者多植物外伤起病慢、疼痛轻、病灶呈牙膏样等，后者常外伤后病菌感染起病急、刺激症状重、病灶脓性；与病毒性角膜炎在病因、临床表现、实验室检查不同，病毒性有复发倾向等；与棘阿米巴角膜炎在病因、临床表现、实验室检查有别，棘阿米巴多因接触污染水致、疼痛剧烈等；儿童需细致问外伤史因表达不清晰，老年人常合并基础疾病要考虑其对病情影响且需及时做角膜刮片等实验室检查来明确诊断指导治疗。
一、与细菌性角膜炎的鉴别
1.病因差异：真菌性角膜炎多有植物性外伤史，如树枝、干草等擦伤角膜；细菌性角膜炎常因外伤后金黄色葡萄球菌、绿脓杆菌等致病菌感染引发。
2.临床表现区别：真菌性角膜炎起病较缓慢、病程长，眼部疼痛相对较轻，角膜病灶呈灰白色、干燥且表面欠光泽，呈牙膏样或苔垢样外观，周围可见免疫环及卫星灶；细菌性角膜炎起病急、发展快，眼部刺激症状重，角膜病灶为脓性，边缘浸润显著。
3.实验室检查不同：真菌性角膜炎角膜刮片镜检可发现菌丝和孢子，真菌培养能分离出致病真菌；细菌性角膜炎角膜刮片可见大量中性粒细胞与细菌，细菌培养可明确致病菌。
二、与病毒性角膜炎的鉴别
1.病因特点：病毒性角膜炎多由单纯疱疹病毒等引起，有复发倾向，常与发热、感冒等诱因相关；真菌性角膜炎无明显复发倾向，主要由植物外伤导致。
2.临床表现差异：病毒性角膜炎角膜病灶多呈树枝状、地图状等，荧光素染色阳性，常伴睫状充血；真菌性角膜炎病灶具特征性外观，荧光素染色虽可阳性但病灶外观有别。
3.实验室检查区别：病毒性角膜炎角膜刮片可发现病毒包涵体，病毒PCR检测呈阳性；真菌性角膜炎依靠真菌相关检查确诊。
三、与棘阿米巴角膜炎的鉴别
1.病因区别：棘阿米巴角膜炎多因角膜接触污染的水所致，如佩戴接触镜时护理不当；真菌性角膜炎主要由植物外伤引起。
2.临床表现差异：棘阿米巴角膜炎眼部疼痛剧烈，与体征不成比例，角膜病灶可呈环形浸润、中央盘状且周围有放射状神经炎；真菌性角膜炎疼痛相对较轻，病灶外观不同。
3.实验室检查不同：棘阿米巴角膜炎角膜刮片可找到棘阿米巴原虫，角膜共聚焦显微镜检查可见棘阿米巴包囊或滋养体；真菌性角膜炎依靠真菌学检查确诊。
特殊人群考量
儿童：儿童眼部结构及免疫力具特殊性，鉴别时需细致询问外伤史，因儿童植物外伤较常见，且儿童表达症状可能不清晰，需结合全面检查以明确诊断。
老年人：常合并基础疾病（如糖尿病等），基础疾病会影响角膜感染表现，鉴别时需充分考虑基础疾病对病情的影响，确保检查全面准确。鉴别过程中强调及时进行角膜刮片等实验室检查的重要性，以快速明确诊断并指导后续治疗。
