心肌肥大症状因个体而异，常见症状有活动后或休息时呼吸困难、全身乏力活动耐力下降、自觉心跳加快心慌的心悸、多样疼痛性质的胸痛、病情严重时的下肢或全身水肿、心输出量减少致脑供血不足的头晕或晕厥。
呼吸困难：这是较为常见的症状，早期可能在活动后出现气促，随着病情进展，休息时也可能发生。例如，患者在爬楼梯、快速行走等轻度活动后就感觉气不够用，需要停下来休息。这是因为心肌肥大导致心脏的舒张和收缩功能受限，肺循环淤血，影响气体交换，进而引起呼吸困难。在不同年龄人群中表现可能有所不同，儿童可能表现为呼吸频率增快、喂养困难等；老年人可能更易在夜间睡眠中因呼吸困难而憋醒，出现阵发性夜间呼吸困难，这与平卧时回心血量增加，加重心脏负担，使肺淤血进一步加重有关。
乏力：患者常感到全身没有力气，活动耐力明显下降。比如原本可以轻松完成的日常活动，现在做起来就感觉很吃力，这是由于心肌肥大使心脏泵血功能减弱，全身组织器官供血不足，导致机体能量供应不足所致。不同性别患者可能都会出现乏力，但女性可能更易被忽视，因为乏力也可能被归因于疲劳等其他因素。有基础病史的患者，如本身有冠心病的患者，心肌肥大可能进一步加重心肌缺血缺氧，使乏力症状更明显。
心悸：患者可自觉心跳加快、心慌，有时能感觉到自己的心脏跳动。这是因为心肌肥大引起心脏节律异常或心脏负荷改变，导致患者对心跳的感知增强。在生活方式方面，如果患者近期有过度劳累、精神紧张等情况，可能会诱发或加重心悸症状。对于儿童患者，家长可能会发现孩子玩耍时突然出现心率加快、不安等表现。
胸痛：部分患者会出现胸痛症状，疼痛性质多样，可为压榨性、闷痛等。这是因为心肌肥大使心肌耗氧量增加，而肥大的心肌供血相对不足，导致心肌缺血缺氧，刺激心脏神经引起胸痛。在不同年龄人群中，儿童心肌肥大导致胸痛相对较少见，而成年人尤其是有高血压、冠心病等基础疾病的人群更易出现。女性患者在绝经后由于雌激素水平变化等因素，可能对疼痛的感知和男性有所不同，但胸痛都是心肌缺血的一种表现。
水肿：多见于病情较严重的患者，可表现为下肢水肿，严重时可波及全身。这是因为心脏泵血功能减退，体循环淤血，静脉回流受阻，液体渗出到组织间隙引起水肿。老年人由于血管弹性下降等因素，水肿可能更难消退。有肾脏基础疾病的患者，心肌肥大可能加重肾脏淤血，导致水肿加重，需要综合考虑心脏和肾脏的情况进行治疗。
头晕或晕厥：严重的心肌肥大可能导致心输出量减少，脑供血不足，从而引起头晕甚至晕厥。例如患者在站立时突然出现头晕，严重时摔倒发生晕厥。在儿童中，心肌肥大导致晕厥相对罕见，但如果有先天性心脏病等基础疾病合并心肌肥大时也可能出现。女性患者在月经期间等特殊生理时期，由于血容量等变化，可能会增加头晕的发生风险。
