肝癌发生的危险因素包括乙型肝炎病毒和丙型肝炎病毒持续感染致风险显著升高，长期大量饮酒引发酒精性肝病经相关过程增加风险，肥胖使非酒精性脂肪性肝病逐步进展为肝癌，摄入含黄曲霉毒素B1的霉变食物损伤肝细胞DNA，遗传性疾病及家族史相关遗传因素增加风险，长期接触化学毒物及华支睾吸虫感染也可能增加肝癌可能性。
一、病毒性肝炎感染
乙型肝炎病毒（HBV）和丙型肝炎病毒（HCV）的持续感染是肝癌发生的重要危险因素。长期的病毒感染会引发肝细胞炎症反应，机体不断进行修复过程，在此过程中肝细胞的基因易发生突变，进而逐渐发展为肝癌。研究表明，HBV感染者发生肝癌的风险较非感染者显著升高数十倍，HCV感染也是导致肝癌的重要病毒性因素之一。
二、酒精性肝病
长期大量饮酒可引起酒精性肝炎、肝纤维化，最终进展为肝硬化，在肝硬化基础上肝癌发生风险明显增加。酒精进入人体后代谢产生乙醛，乙醛具有毒性，会损伤肝细胞的DNA等遗传物质，干扰肝细胞的正常代谢和增殖调控，从而增加肝癌发生几率。
三、非酒精性脂肪性肝病
随着肥胖率上升，非酒精性脂肪性肝病患病率逐渐增高，该病可逐步进展为脂肪性肝炎、肝纤维化、肝硬化，最终引发肝癌。其发生机制涉及胰岛素抵抗、氧化应激等多种因素，胰岛素抵抗会导致肝细胞内脂肪代谢紊乱，氧化应激产生的自由基等会损伤肝细胞，促使肝癌发生。
四、黄曲霉毒素暴露
黄曲霉毒素B1是强致癌物质，若粮食等食物被黄曲霉污染发生霉变，长期摄入含有黄曲霉毒素B1的食物会损伤肝细胞的DNA，干扰细胞的正常增殖和凋亡调控，进而增加肝癌的发生风险。
五、遗传因素
某些遗传性疾病，如遗传性血色病等，会使机体铁代谢异常，导致铁在肝脏等器官沉积，长期铁沉积损伤肝细胞，增加肝癌发生风险。此外，家族中有肝癌病史的人群，其患肝癌的相对风险较无家族史人群升高，可能与遗传易感性等因素相关。
六、其他因素
长期接触某些化学毒物，如亚硝胺类、偶氮芥类等，这些化学物质具有潜在的致癌性，可损伤肝细胞DNA引发癌变。另外，华支睾吸虫感染与胆管细胞癌发生相关，也可能在一定程度上增加肝癌发生的可能性。
