纵隔肿瘤病因尚未完全明确，可能与遗传因素、环境因素（包括电离辐射、化学物质接触）、胚胎发育异常、自身免疫因素、年龄、性别、生活方式、病史因素等多种因素相关，部分纵隔肿瘤有遗传倾向，长期接触电离辐射和化学物质等环境因素可增加发病风险，胚胎发育异常可致纵隔肿瘤形成，自身免疫功能异常可能参与发病，不同年龄段、性别发病有差异，不良生活方式及既往病史也与纵隔肿瘤发病有关。
一、遗传因素
部分纵隔肿瘤具有一定的遗传倾向。例如某些遗传性综合征可能增加纵隔肿瘤的发病风险，研究发现一些基因的突变或异常表达与纵隔肿瘤的发生发展存在关联。若家族中有纵隔肿瘤患者，其他家庭成员患纵隔肿瘤的风险可能相对较高，但这并非绝对，只是遗传因素在其中起到了一定的作用。
二、环境因素
1.电离辐射：长期接触电离辐射是纵隔肿瘤的危险因素之一。如职业环境中接触放射物质的人群，像从事放射相关工作的人员，由于长时间暴露在电离辐射下，细胞受到损伤，DNA发生突变等，从而增加了纵隔肿瘤的发病几率。
2.化学物质接触：长期接触某些化学致癌物质也可能诱发纵隔肿瘤。例如长期接触石棉的工人，石棉纤维可导致纵隔组织细胞发生异常变化，增加患纵隔肿瘤的风险；另外，长期接触某些工业有机溶剂等，也可能对纵隔组织产生不良影响，进而引发肿瘤。
三、胚胎发育异常
在胚胎发育过程中，纵隔部位的组织分化异常可能导致纵隔肿瘤的形成。胚胎时期纵隔内的某些组织残留或异位生长，随着年龄增长等因素，这些异常生长的组织可能逐渐发展成为肿瘤。例如畸胎瘤，就是由于胚胎发育时期原始生殖细胞分化异常，部分组织异位存在，最终形成肿瘤。
四、自身免疫因素
自身免疫功能异常也可能与纵隔肿瘤的发生有关。当机体的免疫系统出现紊乱时，免疫监视功能下降，不能及时清除发生突变的纵隔组织细胞，使得这些细胞得以增殖分化，进而形成肿瘤。例如一些自身免疫性疾病患者，其发生纵隔肿瘤的概率可能高于正常人群，但目前具体的作用机制还在进一步研究中。
五、其他因素
1.年龄因素：不同年龄段纵隔肿瘤的发病情况有所差异。例如儿童纵隔肿瘤的病因可能与胚胎发育异常等因素关系更为密切，而成人纵隔肿瘤则可能与环境因素、遗传易感性等多种因素相关。儿童时期若存在胚胎发育过程中的异常，相对更容易在后续生长发育中形成纵隔肿瘤。
2.性别因素：某些纵隔肿瘤在不同性别中的发病率可能存在差异。比如胸腺瘤在男性和女性中的发病情况有一定不同，但具体的性别相关发病机制还需进一步深入研究来明确。
3.生活方式：长期不良的生活方式，如长期大量吸烟，烟草中的有害物质可通过多种途径影响纵隔组织细胞，增加纵隔肿瘤的发病风险；缺乏运动、长期精神压力过大等也可能通过影响机体的免疫功能等，间接对纵隔肿瘤的发生起到一定作用。
4.病史因素：既往有其他肿瘤病史的患者，发生纵隔肿瘤的风险可能增加。例如有其他部位恶性肿瘤病史的患者，由于肿瘤细胞的转移等因素，可能累及纵隔组织而引发纵隔肿瘤；另外，某些良性疾病长期不愈，也可能逐渐发展为纵隔肿瘤，如纵隔部位的慢性炎症长期刺激等。
