早上起来喉咙痛可能由多种因素引起，包括空气干燥、空气污染、上呼吸道感染（病毒性和细菌性）、咽喉部本身疾病（慢性咽炎、扁桃体炎）、胃食管反流、用嗓过度和过敏因素等，不同因素对不同年龄段和人群影响不同。
一、环境因素相关
（一）空气干燥
夜间睡眠时，若室内空气过于干燥，会使喉咙黏膜水分流失过快，早上起来就容易出现喉咙痛的情况。尤其在冬季，使用暖气或空调时，空气湿度降低更为明显。不同年龄段人群受影响程度类似，但儿童鼻腔、咽喉等黏膜相对娇嫩，更易因空气干燥出现喉咙痛。生活方式上，长期处于空调房或暖气环境且未采取加湿措施的人群风险更高。
（二）空气污染
室外空气污染严重时，如雾霾天气，空气中的颗粒物、有害气体等会刺激咽喉部黏膜。长期暴露于污染环境中的人群，早上起来喉咙痛的概率增加。对于有慢性呼吸道疾病病史的人群，空气污染的刺激可能更易诱发喉咙不适，例如本身患有慢性支气管炎的患者，受空气污染影响后喉咙痛症状可能更明显。
二、上呼吸道感染相关
（一）病毒性上呼吸道感染
常见的病毒如鼻病毒、冠状病毒等感染上呼吸道后，会引起咽喉部炎症反应。在感染初期，可能就会出现早上起来喉咙痛的症状，同时还可能伴有鼻塞、流涕、咳嗽等症状。各年龄段均可发病，儿童由于免疫系统尚未完全发育成熟，相对更容易感染病毒引发上呼吸道感染导致喉咙痛。生活方式中，密切接触病毒携带者、过度疲劳等会增加感染风险，有受凉病史的人群也易诱发病毒性上呼吸道感染出现喉咙痛。
（二）细菌性上呼吸道感染
如A组β溶血性链球菌等细菌感染咽喉部，可引起急性咽炎或扁桃体炎等，导致早上起来喉咙痛，往往还伴有咽喉部充血、肿胀，甚至有脓性分泌物。不同年龄人群均可患病，对于有糖尿病等基础病史的人群，由于机体抵抗力相对较低，更易发生细菌性上呼吸道感染而出现喉咙痛症状。
三、咽喉部本身疾病相关
（一）慢性咽炎
患者咽喉部黏膜长期处于慢性炎症状态，早上起来可能会有喉咙痛、异物感等症状，且症状时轻时重。长期吸烟、饮酒、过度用嗓的人群更容易患上慢性咽炎，进而出现早上喉咙痛的情况。各年龄段均有发病可能，长期生活在污染环境中的人群患病风险也会增加。
（二）扁桃体炎
无论是急性还是慢性扁桃体炎，都可能导致早上起来喉咙痛。急性扁桃体炎多由细菌或病毒感染引起，起病较急，喉咙痛较为明显；慢性扁桃体炎则是反复炎症刺激导致，喉咙痛症状相对较轻但会反复发作。有扁桃体炎病史的人群，在身体抵抗力下降时容易复发，出现早上喉咙痛的情况，儿童时期患扁桃体炎若未规范治疗，可能会影响成年后的咽喉健康。
四、胃食管反流相关
夜间睡眠时，由于体位变化等原因，胃酸可能反流至咽喉部，刺激咽喉黏膜，引起早上起来喉咙痛。肥胖人群、妊娠中晚期女性由于腹压增加等原因，更容易出现胃食管反流现象。有胃病史的人群，如患有胃食管反流病等，发生胃酸反流刺激咽喉导致喉咙痛的风险更高。
五、其他因素相关
（一）用嗓过度
前一天过度用嗓，如长时间大声说话、唱歌等，会使咽喉部肌肉疲劳，黏膜受损，早上起来出现喉咙痛。教师、歌手等职业人群属于用嗓过度的高发人群，各年龄段中经常过度用嗓的人群都可能受到影响，儿童若过度用嗓也可能导致咽喉不适，出现早上喉咙痛情况。
（二）过敏因素
对空气中的过敏原，如花粉、尘螨等过敏，接触后可能引起咽喉部过敏反应，导致早上起来喉咙痛，常伴有瘙痒等症状。过敏体质人群更容易发生此类情况，在花粉季等过敏原浓度较高的时期，过敏相关的喉咙痛更易出现，不同年龄的过敏体质人群均需注意防范。
