透明细胞癌不是肾囊肿癌变，二者是本质不同的疾病。
透明细胞癌是一种起源于肾小管上皮细胞的恶性肿瘤，具有侵袭性，可侵犯周围组织器官。其细胞内含大量糖原或脂质，显微镜下呈透明或空泡状，占肾细胞癌的70%~85%，常见症状包括血尿、腰痛、腹部肿块等。
肾囊肿则是肾脏内出现的液体充满的囊状物，通常为良性病变，形成原因多样，可能与遗传、年龄增长、慢性炎症等因素有关。单纯性肾囊肿多无症状，多囊肾病虽可能引发腰痛、血尿，但属于遗传性疾病，与癌变无直接关联。
虽然肾囊肿在极少数情况下可能恶变形成肾细胞癌（包括透明细胞癌），但二者无必然联系。肾囊肿癌变的风险因素包括年龄、吸烟、高血压等，且需通过病理检查确诊。透明细胞癌的病因更可能与基因突变、遗传倾向相关，如家族性肾透明细胞癌综合征。
