肝癌在特定情况下可能被误诊为肝血管瘤或肝囊肿，但通过综合检查可鉴别。
肝血管瘤和肝囊肿均为肝脏良性病变，影像学表现与肝癌有重叠可能。肝血管瘤在超声下呈高回声团，CT增强可见“快进慢出”强化特征；肝囊肿表现为边界清晰的无回声区，CT呈水样低密度影。而肝癌（尤其是小肝癌）超声可能显示低回声或等回声结节，CT增强呈“快进快出”强化，若影像学特征不典型，如血管瘤合并出血、囊肿内壁不规则时，可能与肝癌混淆，尤其基层医院设备分辨率较低时易误判。
血清肿瘤标志物检测和病理活检是鉴别关键。肝癌患者甲胎蛋白（AFP）常升高，而肝血管瘤、肝囊肿AFP多为阴性；若AFP阴性但影像学可疑，需进一步行磁共振成像（MRI），肝癌在MRI的DWI序列呈高信号，而良性病变多无此表现。最终确诊需靠肝穿刺活检，肝癌细胞可见异型性增生，而血管瘤由异常血管构成，囊肿壁为纤维组织，无癌细胞。
为避免误诊，建议对可疑病灶采用多种检查手段，比如超声筛查后，用CT/MRI增强明确血供特征，结合AFP等标志物，必要时活检。尤其对有乙肝/丙肝病史、肝硬化的高危人群，发现肝脏占位时需高度警惕肝癌，切勿因影像学疑似良性病变而忽视进一步检查。
