药流疼痛程度为中度到重度且因人而异，受个体差异（如对疼痛耐受、病史等）和妊娠情况（妊娠天数不同疼痛不同）影响，其疼痛程度一般不及生孩子但有相似子宫收缩痛性质，特殊人群（严重心血管疾病、精神心理疾病史）药流需特殊对待。
影响药流疼痛程度的因素
个体差异：不同女性对疼痛的耐受程度不同。年轻女性如果平时身体状况较好、对疼痛耐受能力相对较强，可能感觉药流的疼痛相对没那么难以忍受；而年龄较大、本身对疼痛较为敏感或者有过一些特殊病史（如曾经有过较为严重的痛经史等）的女性，可能会觉得药流的疼痛更强烈。比如，有严重痛经史的女性，在药流时子宫收缩引起的疼痛可能会被放大，感觉比一般人更疼。
妊娠情况：妊娠天数不同，药流时的疼痛程度也有差异。妊娠天数较短时，子宫收缩相对可能没那么强烈，疼痛程度相对轻一些；随着妊娠天数增加，子宫需要更强的收缩来排出妊娠组织，疼痛会相应加重。例如，妊娠49天内进行药流，相对妊娠天数更长的情况，疼痛程度可能会稍低，但这也不是绝对的，还与个体对疼痛的耐受等因素有关。
与生孩子疼痛程度的对比
生孩子的疼痛通常被认为是较为剧烈的，属于十级疼痛中的较高等级。而药流的疼痛程度一般达不到生孩子那么剧烈的程度，但它的疼痛性质主要是子宫收缩痛，和生孩子时子宫收缩推动胎儿娩出的疼痛有相似之处，但整体强度相对弱一些。不过，具体的对比也因个体感受不同而有所差异，有的女性可能会觉得药流的疼痛虽然不如生孩子那么严重，但也会给身体和心理带来较大的不适。
对于特殊人群，比如本身有严重心血管疾病的女性，药流过程中的子宫收缩疼痛可能会引起身体的应激反应，加重心血管负担，所以这类女性在药流前需要谨慎评估，并在医生的密切监测下进行；对于有精神心理疾病史的女性，药流引起的疼痛可能会诱发其精神心理方面的不良事件，需要在心理支持下进行药流相关操作。
