龟头型尿道口下裂与家族遗传倾向及多基因遗传模式相关，受雄激素等激素水平异常影响，还因孕期接触化学物质、感染病毒及不合理用药等胚胎发育干扰因素，且早产、低出生体重等也会增加其发生风险。
一、遗传因素
1.家族遗传倾向：尿道下裂存在家族遗传背景，若家族中有亲属患尿道下裂，儿童发生龟头型尿道口下裂风险升高。例如，父亲或兄弟患尿道下裂时，儿子发病概率高于普通人群，提示遗传基因对胚胎尿道正常形成有影响，可能是相关基因发生突变或存在遗传缺陷干扰发育。
2.多基因遗传模式：尿道下裂属多基因遗传，多个相关基因异常组合可致胚胎发育中尿道沟融合等过程障碍，引发龟头型尿道口下裂。
二、激素水平异常
1.雄激素相关问题：胚胎发育中雄激素对尿道正常发育至关重要，若胎儿体内雄激素合成不足或雄激素受体异常，会影响尿道海绵体分化及尿道沟闭合。如先天性肾上腺皮质增生症可致雄激素合成途径异常，使胎儿雄激素水平偏低，干扰尿道正常发育，增加龟头型尿道口下裂风险。
2.其他激素影响：胰岛素样生长因子等其他激素参与尿道发育，若胚胎发育时期此类激素异常，可影响尿道形成，导致尿道口位置异常。
三、胚胎发育干扰因素
1.孕期环境因素：母亲孕期接触邻苯二甲酸酯类等化学物质，可干扰内分泌系统，影响雄激素作用，干扰尿道发育；孕期感染风疹病毒等，也可能对胚胎发育不利，增加龟头型尿道口下裂几率。
2.药物因素：孕期不合理使用某些药物可能干扰胚胎发育中激素平衡或细胞分化等环节，影响尿道发育，增加尿道下裂发生风险。
四、其他相关因素
1.早产因素：早产儿胚胎发育未完全成熟，在尿道发育关键时期受影响更多，发生尿道下裂风险较高，包括龟头型尿道口下裂。
2.出生体重：低出生体重儿发生尿道下裂可能性高，低出生体重反映胚胎宫内发育受不利影响，致尿道发育相关组织结构异常，引发龟头型尿道口下裂。
