肛周脓肿根治手术后部分可能变成肛瘘，与解剖因素（肛周脓肿多起源肛腺感染，手术若未准确找内口等易致瘘管形成，儿童因肛腺特点术后肛瘘风险有差异）和手术操作因素（未完全清除感染组织等易致肛瘘，有基础疾病及生活方式不健康人群更易形成）相关，及时规范手术可降概率但不能杜绝，术后需密切观察，特殊人群有相应护理要求。
解剖因素：肛周脓肿大多起源于肛腺感染，肛腺位于内外括约肌之间，感染容易沿着肛腺蔓延。在进行肛周脓肿根治手术时，如果没有准确找到内口或者处理不当，就可能导致瘘管形成。例如，肛腺的分布以及感染扩散的路径较为复杂，若手术中对内口的判断有误，残留了感染源，就为肛瘘的形成埋下隐患。不同年龄、性别人群中，由于肛门局部解剖结构相似，所以该解剖因素对不同人群影响类似，但儿童由于肛腺发育等特点，相对成人可能更易因肛腺感染引发肛周脓肿，且术后形成肛瘘的风险可能因儿童自身修复等特点有一定差异。
手术操作因素：如果手术时没有完全清除感染的肛腺及坏死组织，或者引流不充分，就容易导致肛瘘形成。比如，手术中对脓肿腔的搔刮不彻底，残留了部分感染组织，术后这些残留组织可能继续感染，进而发展为肛瘘。对于有基础疾病的患者，如糖尿病患者，其自身抵抗力较差，术后感染控制相对困难，更易出现手术相关并发症导致肛瘘形成的情况；而生活方式不健康，如长期酗酒、熬夜等人群，身体处于相对虚弱状态，也会影响术后恢复，增加肛瘘形成的风险。
一般来说，及时、规范的肛周脓肿根治手术可以降低肛瘘形成的概率，但并不能完全杜绝。术后需要密切观察创面恢复情况，若发现有异常分泌物、疼痛等情况，应及时就医检查，以便早期发现是否形成肛瘘并采取相应处理措施。对于特殊人群，如儿童，术后要更加注重局部清洁护理，保持大便通畅，减少对手术创面的刺激；糖尿病患者则需严格控制血糖，促进伤口愈合，降低肛瘘形成风险。
