遗传因素主导先天气质基础，基因调控大脑神经发育相关且双生子研究证实其关键作用，神经生理基础决定初始气质表现，大脑皮层、边缘系统等影响气质特征，婴儿期气质稳定性体现天生性，纵向研究显示婴儿期气质具稳定性且环境是先天气质基础上的微调非根本性重塑。
一、遗传因素主导先天气质基础
遗传因素是孩子气质天生性的重要物质基础。基因决定了大脑神经发育的初始状态，从神经细胞的连接方式到神经递质的分泌模式等，都受基因调控。例如，研究发现某些特定基因变异与婴儿的活动水平、情绪反应性等气质维度密切相关。多项双生子研究也证实，同卵双生子在气质表现上的相似性显著高于异卵双生子，这充分体现了遗传对气质形成的关键作用，遗传因素为孩子的气质奠定了基本的生物学框架，使得不同孩子从出生起就展现出独特的气质倾向。
二、神经生理基础决定初始气质表现
婴儿出生时的神经生理状态已决定了部分气质特征。大脑皮层的发育成熟度、边缘系统的功能特点等都会影响孩子的气质。比如，部分婴儿由于先天边缘系统较为敏感，对外界的微小刺激就会产生较强烈的情绪反应，表现出易激惹等气质特点；而大脑皮层兴奋与抑制平衡状态的先天差异，会导致孩子在活动水平、注意力集中程度等方面呈现出不同的气质表现，这些都是由先天神经生理基础所决定的初始气质表现。
三、婴儿期气质的稳定性体现天生性
大量纵向研究追踪显示，婴儿期展现出的气质特点具有相对稳定性。例如，在婴儿期被评估为高活动性、高情绪反应性的孩子，在幼儿期、儿童期往往仍会表现出类似的气质倾向。虽然随着年龄增长环境因素会对气质产生一定塑造，但这种塑造是在先天气质基础上的微调，无法改变其基本的气质轮廓。这表明孩子的气质在婴儿期初步形成后，会相对稳定地延续下去，进一步佐证了气质的天生性，即先天因素决定了气质的核心框架，后续环境因素主要是对其进行适应性调整而非根本性重塑。