紧急避孕药可致月经紊乱（打乱下丘脑-垂体-卵巢轴激素调节机制致周期改变）、有胃肠道反应（成分刺激黏膜致恶心呕吐等）、出现不规则阴道出血（改变子宫内膜致异常出血）、少数有头晕乏力等症状（激素波动影响神经），肝肾功能不全者需谨慎使用、育龄女性不宜频繁用此作常规避孕方法、青少年因身体未成熟应避免滥用需选适合安全避孕方式。
一、月经紊乱
紧急避孕药主要通过干扰体内激素水平来达到避孕效果，这可能导致月经周期发生改变，表现为月经提前或推迟。例如，有研究显示，服用紧急避孕药后约15%的女性会出现月经周期的明显波动，这是因为药物打乱了正常的下丘脑-垂体-卵巢轴的激素调节机制，影响了子宫内膜的周期性变化。
二、胃肠道反应
部分使用者会出现恶心、呕吐等胃肠道不适症状。这是由于紧急避孕药中的成分对胃肠道黏膜产生刺激，不同个体对这种刺激的敏感程度不同，一般在服药后的短时间内出现，通常持续时间较短，但也有少数人反应较为强烈。
三、不规则阴道出血
服用紧急避孕药后，可能出现不规则阴道出血现象，表现为少量点滴出血或突破性出血。这是因为药物改变了子宫内膜的正常状态，使其不能维持稳定的生长和脱落，从而导致子宫内膜的异常出血情况。
四、其他不适症状
少数人可能出现头晕、乏力等症状，这与药物引起的激素波动对神经系统的影响有关，一般症状较轻，多可在短时间内自行缓解。
五、特殊人群影响
肝肾功能不全者：紧急避孕药需要经过肝肾代谢，肝肾功能不全者服用后可能加重肝肾负担，因此这类人群应谨慎使用紧急避孕药，使用前需咨询医生评估风险。
育龄女性：频繁使用紧急避孕药可能长期干扰内分泌平衡，影响后续的生育功能，因此不建议将其作为常规避孕方法，应选择更安全有效的常规避孕措施。
青少年：由于身体发育尚未完全成熟，内分泌系统相对脆弱，使用紧急避孕药可能对内分泌系统造成更大影响，更应避免滥用紧急避孕药，建议选择适合青少年的安全避孕方式。
