HPV疫苗主要起预防而非治疗已感染HPV的作用，对未感染人群可预防相关宫颈病变等疾病且已感染部分型别仍可预防其他未感染型别再感染降低相关疾病风险，孕妇孕期一般不建议接种、对疫苗成分过敏者禁忌接种、急性发热疾病患者发作期应推迟接种。
一、HPV疫苗对已感染HPV的治疗作用
HPV疫苗主要起预防作用，而非治疗已感染HPV的作用。目前上市的二价、四价、九价HPV疫苗，分别针对不同型别HPV进行预防，其原理是通过刺激机体免疫系统产生特异性抗体，抵御相应型别HPV的感染，降低再次感染不同型别HPV的风险，但无法直接清除已存在的HPV病毒。例如，二价HPV疫苗主要针对HPV16和18型，四价涵盖HPV6、11、16、18型，九价则在四价基础上增加了31、33、45、52、58型，它们均不能对已感染的HPV起到清除或治愈已感染状态的作用。
二、HPV疫苗对预防相关疾病的作用
对于未感染HPV的人群，接种HPV疫苗可有效预防由疫苗所涵盖型别HPV引起的宫颈病变、肛门癌、生殖器疣等疾病。以九价HPV疫苗为例，能预防约90%的宫颈癌、85%的阴道癌、50%的低级宫颈病变、90%的肛门癌、90%的生殖器疣等。即使已经感染部分型别HPV，接种疫苗仍可预防其他未感染型别HPV的再次感染，进而降低因持续感染不同型别HPV导致相关疾病的风险。
三、特殊人群接种注意事项
孕妇：孕期一般不建议接种HPV疫苗，由于目前缺乏足够的孕期接种HPV疫苗的安全性数据，为避免可能对胎儿产生的潜在影响，孕妇应推迟接种，待分娩及哺乳期结束后再考虑接种事宜。
对疫苗成分过敏者：若既往对接种HPV疫苗的任何成分（如疫苗中的某些蛋白质、佐剂等）有严重过敏反应史，则禁忌接种HPV疫苗，以免引发严重过敏事件。
急性发热疾病患者：处于严重急性发热疾病发作期的人群应推迟接种HPV疫苗，待发热等症状缓解、身体恢复健康状态后再安排接种，因为发热等急性疾病可能会影响疫苗接种后的免疫应答效果，甚至加重身体不适。
