肛瘘患者有瘘外口持续或间断流出少量脓性、血性、黏液性分泌物，静止期一般疼痛不明显部分有轻度坠胀感，发作期引流不畅时局部肿胀疼痛炎症加重有明显疼痛甚至跳痛伴感染可发热，分泌物刺激致肛周瘙痒长期可致湿疹样改变，儿童肛瘘少见仅表现为肛周反复搔抓哭闹不安，女性经期症状略加重，部分复杂肛瘘患者有消瘦贫血等全身表现。
一、瘘外口分泌物排出
肛瘘患者通常会有瘘外口持续或间断流出少量脓性、血性、黏液性分泌物的表现。这是因为肛瘘的瘘管内会不断产生分泌物，这些分泌物会通过外口排出体外，分泌物的量和性质可能因瘘管的通畅程度等因素有所不同，若瘘管发生感染，分泌物可能会增多且呈脓性。
二、肛周疼痛
1.静止期疼痛情况：在肛瘘静止期，患者一般疼痛不明显，部分患者可能仅感肛周有轻度坠胀感等。
2.发作期疼痛表现：当瘘管引流不畅时，会出现局部肿胀疼痛，炎症加重时可伴有明显的疼痛，甚至可出现跳痛等，若伴有感染还可能出现发热等全身症状，这是因为引流不畅导致局部炎症积聚，刺激周围组织引起疼痛。
三、肛周瘙痒
由于肛瘘外口排出的分泌物会刺激肛周皮肤，患者常出现肛周瘙痒不适的症状，长期的分泌物刺激可使肛周皮肤出现湿疹样改变，表现为皮肤潮湿、粗糙、瘙痒难耐等，尤其在夜间瘙痒可能会更为明显，影响患者的生活质量。
四、不同人群的特殊表现
1.儿童肛瘘：儿童肛瘘相对少见，但也可出现外口分泌物、肛周不适等表现，由于儿童表述能力有限，可能仅表现为肛周反复搔抓、哭闹不安等，家长需密切观察儿童肛周情况，及时发现异常。
2.女性肛瘘：女性肛瘘患者在经期时，由于局部生理状态的变化，可能会导致肛瘘相关症状略有加重，如分泌物增多、瘙痒或疼痛稍有加剧等，此时更需注意保持肛周清洁卫生，避免感染进一步加重。
五、其他可能伴随表现
部分复杂肛瘘患者可能会出现消瘦、贫血等全身表现，这是因为长期慢性炎症消耗身体能量及营养，且反复的感染出血等情况可能导致贫血，但这种情况相对较少见，多发生在病情较为严重、病程较长的患者身上。
