人乳头瘤病毒（HPV）感染是引起尖锐湿疣的主要原因，低危型HPV6型和HPV11型最主要，通过皮肤或黏膜微小破损进入上皮细胞致病变，超90%患者由其感染，性活跃人群易感染，16-35岁高发；性行为中无保护性行为及性伴侣数量多是重要诱因，无保护性行为使病毒易传播，性伴侣多增加感染机会；免疫功能低下也是诱因，先天性免疫缺陷患者及后天性免疫功能低下人群（如患慢性疾病、免疫抑制治疗、长期熬夜劳累等）易感染HPV引发尖锐湿疣，如艾滋病患者感染后患病概率高且病情严重难治疗。
性行为因素是重要诱因
无保护性行为：不使用安全套等保护措施的性行为会显著增加尖锐湿疣的感染风险。因为安全套可以在一定程度上减少皮肤和黏膜与含有HPV的体液或病变部位的直接接触，而无保护性行为时，病毒更容易通过性接触传播。例如，有研究对比了使用安全套和不使用安全套的人群，发现不使用安全套者感染HPV相关疾病包括尖锐湿疣的概率明显高于使用安全套者。
性伴侣数量多：拥有多个性伴侣的人感染HPV的机会大大增加。因为性伴侣越多，接触不同HPV亚型感染源的可能性就越大，从而增加了感染尖锐湿疣的风险。比如，流行病学调查显示，性伴侣数大于10个的人群，尖锐湿疣的发病率明显高于性伴侣数少的人群。
免疫功能低下也是诱因之一
先天性免疫缺陷：一些先天性免疫缺陷疾病的患者，由于自身免疫系统存在缺陷，对HPV的清除能力减弱，更容易感染HPV并发展为尖锐湿疣。例如，先天性胸腺发育不全的患者，其细胞免疫功能低下，对病毒的抵御能力较差，感染HPV后发生尖锐湿疣的几率比正常人高很多。
后天性免疫功能低下：长期患有慢性疾病（如艾滋病、糖尿病等）、接受免疫抑制治疗（如器官移植后使用免疫抑制剂）或长期熬夜、过度劳累等导致机体免疫功能下降的人群，也容易感染HPV并引发尖锐湿疣。以艾滋病患者为例，由于其免疫系统被HIV严重破坏，机体对HPV的清除能力极弱，感染HPV后发生尖锐湿疣的概率远高于健康人群，而且病情往往更严重、更难治疗。
