肛周脓肿主要由肛腺感染引起，肛窦易受粪便损伤致感染蔓延至肛腺形成。局部因素有肛窦感染，儿童因肛窦特点易感染，成人长期腹泻便秘等增感染概率，女性会阴部结构可能影响感染扩散，肛门损伤如外伤、异物等致细菌侵入；全身因素包括免疫力低下，糖尿病等基础病、老年人、儿童易因免疫力低引发，还有少见的血液传播，身体其他部位感染灶经血液循环致肛周感染。
一、局部因素
1.肛窦感染：肛窦形似口袋，开口向上，粪便易积存于此，导致细菌滋生，引发肛窦炎。儿童由于肛窦相对较深、肛腺发育不完善等原因，相对成人更易发生肛窦感染进而引发肛周脓肿，但儿童的肛窦结构特点也使得其感染扩散相对有一定局限；成人若存在长期腹泻、便秘等情况，会增加肛窦受损及感染的概率。女性和男性在肛窦感染的易感性上无明显性别差异，但女性由于会阴部解剖结构相对复杂，在某些情况下可能影响感染的扩散路径。
2.肛门损伤：外伤、异物损伤等可使细菌侵入肛腺。例如，长期便秘者排便时过度用力，可能导致肛管皮肤及肛窦损伤；性生活中不当的外力作用等也可能造成肛门局部损伤，从而为细菌入侵创造条件。不同生活方式的人群发生肛门损伤的概率不同，长期从事重体力劳动、久坐久站等人群相对更易因局部摩擦等导致肛门损伤。
二、全身因素
1.免疫力低下：患有糖尿病等基础疾病的人群，血糖控制不佳时，机体免疫力下降，容易遭受细菌感染，且感染后不易控制，更易引发肛周脓肿。老年人由于身体机能衰退，免疫力相对较低，相比年轻人更易发生肛周脓肿；儿童时期免疫系统尚未完全发育成熟，免疫力相对较弱，也是肛周脓肿的易发人群。例如，糖尿病患者血糖长期处于高水平，会影响白细胞的吞噬功能，使机体抗感染能力下降，使得肛腺感染难以局限，进而形成肛周脓肿。
2.血液传播：虽然较为少见，但身体其他部位的感染病灶通过血液循环传播至肛周组织也可引发肛周脓肿。如远处的皮肤感染灶，细菌可随血液循环到达肛周，引起局部感染。这种情况在有全身性感染性疾病的患者中可能发生，比如患有败血症的患者，细菌随血流到达肛周组织，导致肛周脓肿的形成。
