肛管癌发生于肛管齿状线至肛缘，病理以鳞状细胞癌为主且与HPV感染相关，直肠癌发生于直肠乙状结肠交界处至齿状线，病理多样以腺癌常见，受长期高脂低纤维饮食、遗传因素、直肠慢性炎症等影响，年龄性别上直肠癌中老年高发，肛管癌HPV相关型在年轻女性有倾向，生活方式上长期高脂低纤维是直肠癌高危因素，肛管癌HPV相关型与不安全性行为相关，病史方面有直肠慢性炎症病史增直肠癌风险，有肛管HPV感染病史增肛管癌风险。
一、解剖部位界定
肛管癌是指发生于肛管齿状线至肛缘这一特定解剖区段的恶性肿瘤，而直肠癌是指发生于直肠乙状结肠交界处至齿状线之间的恶性肿瘤，二者均属于肛管直肠区域的肿瘤性病变，只是发病的具体解剖部位不同。
二、病理特点差异
肛管癌：病理类型以鳞状细胞癌较为多见，其发生可能与人类乳头瘤病毒（HPV）感染关系密切，有研究表明特定亚型的HPV感染是肛管鳞状细胞癌的重要致病因素之一。
直肠癌：病理类型多样，腺癌是最常见的类型，其发生与多种因素相关，如长期高脂、低纤维的饮食结构会增加直肠癌发病风险，另外遗传因素如家族性腺瘤性息肉病等遗传综合征可显著提高个体患直肠癌的遗传易感性，还有直肠慢性炎症性疾病（如溃疡性结肠炎等）长期不愈也会增加直肠癌的发生几率。
三、临床表现及相关影响因素
年龄性别因素：直肠癌在中老年人群中相对更易高发，而肛管癌在某些特定人群中可能有不同表现，比如HPV相关的肛管癌在年轻女性等特定人群中可能有一定发病倾向，但总体而言不同性别在肛管直肠癌发病上无绝对特异性的严格区分，不过不同年龄阶段人群由于生理功能等差异，在症状呈现及病情进展等方面可能会有不同特点，如老年患者可能身体素质相对较弱，对肿瘤相关症状的耐受及反应可能与中青年有所不同。
生活方式因素：长期高脂、低纤维饮食是直肠癌的高危生活方式因素，而肛管癌中HPV相关类型可能与不安全性行为等生活方式相关，不健康的生活方式会不同程度影响肛管直肠癌的发生风险及疾病进程。
病史因素：有直肠慢性炎症病史（如溃疡性结肠炎）的人群患直肠癌风险显著升高，有肛管HPV感染病史等情况则可能增加肛管癌的发病风险，既往的这些病史会成为评估肛管直肠癌发生及病情发展的重要参考因素。
