药流存在多方面危害，包括出血问题，可能大量出血、出血时间长，影响贫血及引发休克等；流产不全，约10%-15%女性会出现，致持续出血、腹痛、感染，影响生育；感染风险，因出血时间长、宫颈开放易细菌逆行感染，可致多种感染性疾病；对内分泌影响，致月经失调，影响青春期发育及育龄期受孕；还有心理影响，致焦虑、抑郁等不良情绪。
药物流产过程中可能出现阴道大量出血的情况。有研究表明，药物流产后阴道出血时间较长，平均出血时间约为14-18天，部分女性出血量可能超过月经量，甚至需要进行清宫手术来止血，这是因为药物流产后胚胎组织排出不完全，影响子宫收缩导致出血异常。对于本身有贫血病史的女性，药流后大量出血会加重贫血状况，影响身体恢复，甚至可能引发失血性休克等严重并发症。
流产不全
约有10%-15%的女性在药物流产后会出现流产不全的情况，即宫腔内仍有胚胎组织残留。残留的组织会影响子宫正常修复，导致持续阴道出血、腹痛等症状，还容易引起宫腔感染。如果不及时处理，宫腔感染可能向上蔓延，引发盆腔炎、输卵管炎等疾病，进而影响今后的生育功能，如导致输卵管堵塞，增加异位妊娠（宫外孕）的发生风险。对于有多次流产史或子宫畸形等特殊病史的女性，流产不全的发生率可能更高，因为子宫的异常结构或多次损伤会影响胚胎组织的完全排出。
感染风险
药物流产后，由于阴道出血时间较长，宫颈口处于开放状态，细菌容易逆行感染宫腔。一旦发生宫腔感染，可出现发热、下腹部疼痛、阴道分泌物有异味等症状。感染若未能及时控制，可能扩散至盆腔，形成盆腔脓肿等严重感染性疾病。年轻女性若不注意术后卫生，或者本身有阴道炎症等基础疾病，感染的风险会进一步增加。
对内分泌的影响
米非司酮和米索前列醇等药物会影响女性的内分泌系统。药物流产后，体内的激素水平会发生波动，可能导致月经失调，出现月经周期紊乱、月经量增多或减少等情况。这种内分泌的紊乱对于青春期女性来说，可能会影响其正常的生长发育和生殖内分泌功能的建立；对于育龄期有生育计划的女性，月经失调会干扰受孕的时间判断，增加受孕难度。
心理影响
药物流产过程相对痛苦，术后出现的各种不适症状如出血、腹痛等以及可能面临的流产不全、感染等风险，会给女性带来较大的心理压力，容易引发焦虑、抑郁等不良情绪。尤其是那些对流产存在恐惧心理或者有特殊心理状况的女性，如既往有过心理创伤的女性，心理影响可能更为明显，需要家人和社会给予更多的心理支持和关怀。
