传染性软疣有一定自愈可能，但受自身免疫力、疣体数量大小影响，疣体影响生活、特殊人群（儿童、免疫力低下人群）等情况不建议等待自愈，需及时就医处理。
一、自愈情况及影响因素
1.自身免疫力影响
对于免疫力正常的人群，部分传染性软疣有可能自行消退。一般来说，儿童和青少年的免疫系统尚在发育过程中，若自身免疫力较好，传染性软疣有一定几率在数月至数年不等的时间内自愈。例如，一些体质较好、营养状况良好且没有其他基础疾病的儿童，其免疫系统能够较好地应对病毒感染，传染性软疣可能会随着自身免疫力的增强逐渐消退。而成年人中，若免疫力正常，也存在传染性软疣自行消退的情况，但相对儿童可能时间上不一定更短，同样受个体差异影响。
而对于免疫力低下的人群，如患有艾滋病等免疫缺陷疾病的患者，传染性软疣自行消退的可能性较小，而且病情可能会持续加重，疣体数量可能增多，疣体也可能增大，因为免疫系统无法有效清除病毒，病毒会持续在体内活跃复制，导致传染性软疣难以自行痊愈。
2.疣体数量和大小影响
当疣体数量较少、体积较小时，相对更容易出现自愈情况。比如仅有1-2个较小的疣体，免疫系统有可能将病毒逐步清除，从而使疣体消退。但如果疣体数量较多或者体积较大，自愈的概率会降低，因为病毒感染的范围较广或者病毒在局部的复制较为活跃，仅依靠自身免疫力可能难以完全清除病毒。
二、不建议等待自愈的情况及应对
1.疣体影响生活时
若传染性软疣生长在容易摩擦的部位，如颈部、腋窝等，由于日常活动的摩擦，疣体可能会破溃、出血、继发感染等，此时不建议等待自愈，应及时就医处理。例如，颈部的传染性软疣，在低头、转头等活动时容易受到摩擦，可能引起不适甚至感染，这种情况下就需要积极干预，而不是等待自愈。
对于生长在面部等影响美观的部位的传染性软疣，患者可能会因为外观问题产生心理压力，也不建议等待自愈，应尽早采取合适的治疗措施，如医生可能会采用疣体夹除术等方法进行处理。
2.特殊人群
儿童：儿童的皮肤较为娇嫩，传染性软疣若不及时处理，可能会因为搔抓等导致疣体扩散，而且儿童自身不太能控制搔抓行为，所以对于儿童的传染性软疣，即使有自愈可能，若疣体有扩散趋势或者影响局部皮肤状况，也应尽早干预。比如儿童手部出现传染性软疣，若不处理，孩子可能会搔抓手部，导致疣体传播到身体其他部位或者传染给他人。
免疫力低下人群：如前文所述，免疫力低下人群传染性软疣自愈可能性小且易加重病情，所以这类人群一旦发现传染性软疣，应及时就医，采取积极的治疗措施，而不能等待自愈，以免延误病情，导致更严重的局部皮肤问题甚至全身健康影响。
