肛周脓肿与囊肿在定义病理、临床表现、影像学及实验室检查、治疗原则上有差异，脓肿多因肛腺感染致急性化脓感染形成脓肿，有明显红、肿、热、痛及全身症状，影像学可现液性暗区等，需手术引流；囊肿多为良性囊性病变，局部症状缓，影像学现囊性结构，较小无症状可观察，较大或有症状需手术。
一、定义与病理本质
1.肛周脓肿：是肛管直肠周围软组织或其周围间隙发生的急性化脓性感染，并形成脓肿。多因肛腺感染蔓延所致，细菌感染后引起组织化脓性炎症反应，逐渐形成脓液积聚的脓肿病灶，病理上以中性粒细胞浸润等急性炎症表现为主。各年龄段均可发病，男性相对多见，常与不良生活方式如久坐、局部卫生不佳等有关，有肛肠疾病病史者更易发生。
2.肛周囊肿：一般是肛周囊性的病变，多为良性，其来源多样，如上皮样囊肿可能是胚胎发育残留的上皮组织发展而来，表皮样囊肿可因外伤致表皮植入等因素形成，病理上以囊壁包裹的囊性结构为特征，内容物多为囊液等，相对肛周脓肿来说炎症反应通常没那么急重。不同类型肛周囊肿好发年龄等有差异，生活方式影响相对肛周脓肿没那么直接关联。
二、临床表现差异
1.肛周脓肿：局部多有明显红、肿、热、痛表现，发病较急，疼痛较为剧烈，常呈持续性跳动性疼痛，可伴有发热等全身症状，若脓肿位置较深，全身症状可能更明显，比如深部肛周脓肿可引起寒战、乏力等，年龄较小患者可能因表达不清而表现为哭闹不安等，男性与女性在表现上无绝对特异性差异，但男性若有久坐等不良生活方式可能增加发病几率。
2.肛周囊肿：一般局部症状相对较缓，囊肿较小的时候可能无明显不适，较大囊肿可能有局部隆起等表现，疼痛多不剧烈，全身症状通常不明显，不同类型肛周囊肿表现有一定区别，如表皮样囊肿等，各年龄段均可出现，生活方式影响相对不突出作为主要致病因素。
三、影像学及实验室检查区别
1.影像学：
肛周脓肿：超声检查可发现肛周异常的液性暗区等化脓性改变表现，CT或MRI检查能清晰显示脓肿的位置、大小、与周围组织关系等，炎症区域表现为异常强化等炎症征象，各年龄段检查适用情况类似，男性女性无特殊，生活方式影响检查结果判断的关联不大。
肛周囊肿：超声可显示肛周囊性的无回声或低回声区等囊性结构特点，CT或MRI可见边界相对清晰的囊性病灶，内容物密度或信号有其特征，不同类型囊肿表现有差异，年龄对检查影响主要是儿童检查需注意辐射等情况，女性孕期等特殊情况检查需权衡。
2.实验室检查：
肛周脓肿：血常规常可见白细胞及中性粒细胞升高，有感染严重时变化更明显，各年龄段均可出现相应变化，男性女性无特异性，生活方式不好可能导致感染易发生进而影响实验室指标。
肛周囊肿：血常规一般无明显异常，各年龄段检查情况类似，女性特殊时期如孕期等检查需考虑自身及胎儿情况。
四、治疗原则不同
1.肛周脓肿：多需手术治疗，如脓肿切开引流术等，尽快排出脓液控制感染，各年龄段手术需考虑其耐受性等，男性女性手术操作无绝对性别差异，生活方式调整如术后保持肛周清洁等很重要。
2.肛周囊肿：较小无症状囊肿可观察，较大或有症状囊肿多需手术切除等治疗，各年龄段处理需考虑其生长等情况，女性孕期等特殊情况囊肿处理需谨慎评估。
