异位妊娠的原因包括输卵管因素（输卵管炎症、手术史）、受精卵游走、输卵管发育不良或功能异常、辅助生殖技术、避孕失败、子宫肌瘤或卵巢肿瘤压迫、子宫内膜异位症等，其中输卵管炎症是最主要原因，性传播疾病史女性异位妊娠发生率高，输卵管手术史等会增加风险，受精卵游走相对少见，输卵管发育不良或功能异常影响受精卵运行，辅助生殖等使异位妊娠发生率增加，避孕失败、肿瘤压迫、子宫内膜异位症也可致异位妊娠。
1.输卵管炎症：是异位妊娠最主要的原因。包括输卵管黏膜炎和输卵管周围炎。输卵管黏膜炎轻者可使黏膜皱褶粘连，管腔变窄，或使纤毛功能受损，影响受精卵在输卵管内的正常运行；严重者可引起输卵管完全堵塞导致不孕。输卵管周围炎主要病变在输卵管的浆膜层或浆肌层，常造成输卵管周围粘连，输卵管扭曲，管腔狭窄，管壁肌蠕动减弱，影响受精卵的运行。例如，性传播疾病如淋病奈瑟菌、衣原体感染等可引起输卵管炎症，据相关研究统计，有过性传播疾病史的女性异位妊娠发生率比无此病史者高10-20倍。
2.输卵管手术史：曾行输卵管绝育术、输卵管复通术、输卵管成形术等手术的女性，输卵管的结构和功能可能受到影响，增加异位妊娠的风险。比如，输卵管绝育术后若发生输卵管再通，受精卵可能在狭窄的部位着床；输卵管成形术后，输卵管的形态和通畅程度改变，也会影响受精卵的正常运输。有输卵管手术史的女性异位妊娠发生率较无手术史者高10%-20%。
受精卵游走
受精卵在一侧输卵管受精后，经宫腔或腹腔进入对侧输卵管，称为受精卵游走。由于受精卵移行时间过长，发育增大，即可在对侧输卵管内着床形成异位妊娠。一般这种情况相对较少见，但也是异位妊娠的一个可能原因。
输卵管发育不良或功能异常
1.输卵管发育不良：如输卵管过长、肌层发育差、黏膜纤毛缺乏等，均可影响受精卵的正常运行。例如，输卵管过长时，受精卵到达宫腔的时间延长，在输卵管内着床的可能性增加。
2.输卵管功能异常：内分泌失调、精神紧张等可引起输卵管功能异常，影响受精卵的正常输送。研究发现，精神过度紧张时可导致输卵管痉挛和蠕动异常，干扰受精卵的运送。
其他因素
1.辅助生殖技术：随着辅助生殖技术的广泛应用，异位妊娠的发生率有所增加。这与胚胎移植技术、受精卵的质量、宫腔内环境等多种因素有关。例如，体外受精-胚胎移植（IVF-ET）后异位妊娠的发生率约为3%-8%，比自然妊娠高2-3倍。
2.避孕失败：包括宫内节育器避孕失败、口服紧急避孕药失败等。宫内节育器避孕失败时，妊娠发生在宫内的机会减少，发生异位妊娠的机会相对增加；口服紧急避孕药失败后，也可能出现异位妊娠。例如，使用含铜宫内节育器避孕的女性，妊娠时异位妊娠发生率约为0.5%，而未使用宫内节育器者异位妊娠发生率约为1%，但使用宫内节育器避孕失败时异位妊娠风险明显升高。
3.子宫肌瘤或卵巢肿瘤压迫：子宫肌瘤或卵巢肿瘤可压迫输卵管，影响输卵管的通畅性，使受精卵运行受阻，从而增加异位妊娠的发生几率。例如，较大的子宫肌瘤可压迫输卵管，导致输卵管管腔狭窄或阻塞，影响受精卵通过。
4.子宫内膜异位症：子宫内膜异位症可引起盆腔粘连，改变输卵管的形态和功能，是异位妊娠的高危因素之一。研究表明，子宫内膜异位症患者异位妊娠的发生率比正常女性高5-10倍，尤其是卵巢子宫内膜异位症，可影响输卵管的拾卵和受精卵的运输功能。
