支原体因缺乏细胞壁传统抗生素无效且起效慢致需长疗程，儿童免疫不完善、免疫力低下人群清除能力受限，感染后易引发气道炎症致气道高反应性持续从而延长病程。
一、支原体生物学特性相关因素
支原体缺乏细胞壁结构，传统针对细菌细胞壁的抗生素对其无效，临床常用大环内酯类等抗生素需通过抑制支原体蛋白合成发挥作用，其起效及清除病原体的过程相对缓慢，一般需要持续用药2~3周甚至更长疗程才能较好控制感染，这是支原体感染病程较长的基础生物学原因。例如，有研究指出，支原体感染后依靠常规抗生素治疗达到病原体有效清除往往需要一定时间积累来抑制其生长繁殖。
二、宿主因素影响
（一）儿童群体
儿童免疫系统发育尚不完善，面对支原体感染时，机体的免疫应答反应相对成年人更易出现紊乱或恢复较慢。儿童的呼吸道黏膜等防御屏障功能相对较弱，支原体感染后引发的炎症反应持续时间可能更长，且儿童自我修复能力相对有限，使得支原体感染在儿童群体中病程往往偏长。例如，多项儿科临床研究显示，儿童支原体肺炎患者的病程较成人更长，部分需要2~4周甚至更久才能完全康复。
（二）免疫力低下人群
老年人、患有基础疾病（如糖尿病、艾滋病等）或长期使用免疫抑制剂者，其自身免疫力较弱，机体清除支原体的能力受限。这类人群感染支原体后，身体难以迅速调动有效的免疫机制来快速清除病原体，炎症反应持续时间延长，从而导致感染病程迁延不愈。
三、感染后并发症及气道反应性改变
支原体感染后易引发气道炎症反应，即使病原体已被部分控制，气道炎症导致的气道高反应性仍可能持续存在。患者会表现出持续咳嗽等症状，而气道高反应状态的缓解需要一定时间，这就使得整个感染的时间周期被延长。例如，支原体感染引起的肺炎患者，在支原体被抑制后，气道黏膜的修复以及高反应状态的消退往往需要数周时间，进而延长了患者感觉不适的时间。
