胎记形成与遗传因素中家族遗传倾向及特定基因变异有关，胚胎发育早期血管和皮肤组织形成阶段异常可致，血管性胎记由先天性血管畸形或增生引起，色素性胎记因黑色素细胞迁移分布异常，部分血管瘤与婴儿激素水平变化相关，孕期母亲接触化学物质等环境因素也可能增加风险。
一、遗传因素
某些胎记的发生存在家族遗传倾向，若家族中有胎记患者，后代发生胎记的风险可能相对增加，相关研究显示部分胎记的遗传机制与特定基因的突变或遗传变异有关，例如部分色素性胎记可能与遗传基因对黑色素细胞调控的异常相关。
二、胚胎发育过程异常
胚胎发育早期，尤其是血管系统及皮肤组织形成阶段，若出现基因突变或细胞分化异常，会影响皮肤组织的结构和色素分布。例如在神经管闭合等关键发育环节出现异常时，可能干扰皮肤相关组织的正常发育，进而引发胎记，此阶段的异常是多种胎记形成的重要起始因素。
三、血管异常
先天性血管畸形或增生是血管性胎记（如鲜红斑痣、草莓状血管瘤等）的主要成因。胚胎时期血管发育调控机制紊乱，致使血管在皮肤内异常增殖或畸形分布，像草莓状血管瘤是由于胚胎期血管内皮细胞异常增殖所致，最终表现为不同类型的血管性胎记。
四、色素相关因素
黑色素细胞在胚胎发育中迁移、分布异常可引起色素性胎记，以太田痣为例，胚胎发育时黑色素细胞从神经嵴向表皮移行过程中，未能正常进入表皮深层而滞留在真皮层内，导致皮肤出现色素沉着斑，这是色素性胎记形成的典型机制。
五、激素影响
部分胎记发生与激素水平有关，例如婴儿出生后出现的血管瘤，可能与婴儿体内激素水平变化相关，在婴儿生长发育早期，激素波动可能刺激血管异常增生从而形成血管瘤类胎记，尤其在婴儿激素分泌不稳定阶段更易受影响。
六、环境因素
孕期母亲接触某些化学物质、受到辐射等可能对胚胎发育产生不良影响，虽证据相对有限，但仍可能增加胎儿出现胎记的风险，不过这种情况相对较少见，属于潜在的影响因素。
