真菌性脑膜炎感染途径分内外源，外源性包括呼吸道吸入如新型隐球菌孢子经空气传播定植肺部后血行播散致脑膜，以及颅脑外伤或手术致外界真菌直接侵入中枢；内源性是免疫功能低下人群如艾滋病、糖尿病、恶性肿瘤患者因基础疾病或长期用广谱抗生素、糖皮质激素致体内条件致病性真菌增殖侵袭中枢神经系统引发脑膜炎。
一、外源性感染途径
（一）呼吸道吸入真菌孢子
1.常见真菌种类及传播：新型隐球菌是导致真菌性脑膜炎较为常见的病原菌，其孢子可通过空气传播，人们在呼吸过程中，孢子会进入呼吸道。例如，在一些环境卫生条件较差、真菌孢子浓度较高的环境中，如长期未打扫的阴暗潮湿环境、特定的真菌培养实验室周边等，人体吸入新型隐球菌孢子后，孢子会在肺部定植并繁殖，之后可通过血行播散途径到达中枢神经系统，进而引发真菌性脑膜炎。
（二）直接接触感染
1.特殊情况：当颅脑受到外伤导致颅骨破损，或者进行颅脑手术等操作使中枢神经系统与外界直接相通时，外界环境中的真菌有可能直接侵入中枢神经系统。比如严重的开放性颅脑外伤患者，若伤口处理不及时或不规范，环境中的真菌就有机会通过破损的颅脑组织侵入，从而引发真菌性脑膜炎。
二、内源性感染途径
（一）免疫功能低下人群的条件致病
1.基础疾病影响：患有艾滋病的患者，由于免疫系统被HIV病毒严重破坏，机体对真菌的抵御能力大幅下降，原本在人体口腔、肠道等部位定植的条件致病性真菌（如念珠菌）可能大量增殖并侵袭中枢神经系统；糖尿病患者长期血糖控制不佳时，机体免疫功能也会受到影响，容易让念珠菌等真菌有可乘之机侵入中枢神经系统；恶性肿瘤患者在接受化疗、放疗过程中，免疫功能受到抑制，体内原本存在的曲霉菌等条件致病菌可能趁机侵袭中枢神经系统引发脑膜炎。
2.药物使用影响：长期使用广谱抗生素的患者，会破坏体内正常的菌群平衡，使得一些条件致病性真菌（如白色念珠菌）过度生长，进而可能通过血行等途径扩散至中枢神经系统；长期应用糖皮质激素的患者，其免疫功能被抑制，也增加了真菌性脑膜炎的发生风险，因为糖皮质激素会削弱机体对真菌的免疫清除能力，让真菌有机会在体内繁殖并侵袭中枢神经系统。
