胎停原因包括胚胎染色体异常（多由父母生殖细胞减数分裂异常等致）、母体全身性疾病（如严重感染等影响胎盘血供）、生殖器官异常（如子宫畸形等影响着床发育）、内分泌异常（如黄体功能不全等）、免疫功能异常（如自身免疫抗体相关疾病等）、父亲精子染色体异常及环境中过多接触放射性物质、化学毒物等损伤遗传物质或干扰发育内环境。
一、胚胎因素
胚胎染色体异常是早期胚胎停育最主要的原因，约占50%-60%，其中多数为染色体数目异常，如三体（如13-三体、18-三体、21-三体等）、单体等，结构异常相对较少。染色体异常可能由父母生殖细胞在减数分裂时发生染色体不分离、遗传物质突变等引起，这种异常胚胎通常无法正常发育，导致胎停。
二、母体因素
1.全身性疾病：孕妇患有严重感染（如败血症等）、高热疾病、严重贫血或心力衰竭、血栓性疾病等，可影响胎盘血液循环，进而导致胚胎供血不足引发胎停；此外，糖尿病患者血糖控制不佳时，高血糖环境也可能干扰胚胎发育。
2.生殖器官异常：子宫畸形（如单角子宫、双角子宫、纵隔子宫等）会使宫腔形态异常，影响胚胎着床及发育空间；宫腔粘连会减少子宫内膜面积，不利于胚胎种植；子宫肌瘤尤其是黏膜下子宫肌瘤，可影响宫腔内环境，阻碍胚胎生长。
3.内分泌异常：黄体功能不全可导致孕激素分泌不足，无法维持子宫内膜蜕膜化，影响胚胎着床及发育；甲状腺功能减退时，甲状腺激素水平降低会干扰胚胎的正常代谢和发育进程；糖尿病患者血糖控制不良时，高血糖环境同样会对胚胎发育产生不利影响。
4.免疫功能异常：自身免疫性抗体相关疾病（如抗磷脂抗体综合征）可引起胎盘血管血栓形成，减少胎盘血供；同种免疫异常中，母体对胚胎的免疫排斥反应过强，也可能导致胚胎被攻击而发生胎停。
三、父亲因素
父亲精子染色体异常可增加胚胎染色体异常的风险，从而引发胎停。例如精子染色体数目或结构的异常，可传递给胚胎，导致胚胎染色体异常，最终造成胎停。
四、环境因素
过多接触放射性物质（如长期处于高辐射环境）、化学毒物（如苯、甲醛、农药等），这些有害物质可能损伤胚胎的遗传物质或干扰胚胎发育的内环境，增加胎停的发生几率。
