脑血栓引发头疼的原因包括颅内压变化相关、血管因素影响和神经功能紊乱所致。颅内压变化时局部脑组织缺血缺氧致水肿使颅内压升高刺激痛觉敏感结构引发头疼；血管因素有血管痉挛致血液供应减少刺激痛觉感受器及血流动力学改变致局部血流灌注不足引发头疼；神经功能紊乱时累及神经功能区域致神经功能失调出现异常疼痛感觉引发头疼，不同年龄、基础疾病、性别、生活方式等的患者表现有差异。
脑血栓形成后，局部脑组织缺血、缺氧，可引起脑组织水肿，进而导致颅内压升高。颅内压升高会刺激颅内的痛觉敏感结构，如脑膜、血管等，从而引发头疼。例如，相关研究表明，在脑血栓患者中，约有一定比例的患者因脑水肿导致颅内压增高而出现头疼症状，这种头疼往往表现为持续性的胀痛，可能伴有恶心、呕吐等症状。不同年龄的脑血栓患者，由于其身体的代偿能力不同，颅内压升高引发头疼的表现可能会有差异，一般来说，老年患者代偿能力相对较弱，头疼可能相对更为明显。
血管因素影响
血管痉挛：脑血栓发生时，局部血管受损，可能会引起血管痉挛。血管痉挛会导致脑部血液供应进一步减少，同时也会刺激血管壁上的痛觉感受器，从而引发头疼。研究发现，脑血栓后血管痉挛的发生与病情的严重程度有一定关联，严重的血管痉挛可能使头疼症状加重且持续时间延长。对于有高血压、高血脂等基础疾病的脑血栓患者，血管痉挛引发头疼的风险可能相对较高，因为这类患者本身血管状态较差，更容易出现血管的异常收缩。
血流动力学改变：脑血栓会影响脑部的血流动力学，使脑部血流灌注发生变化。当脑部某一区域血流灌注不足时，会导致局部脑组织功能异常，进而引发头疼。不同性别、不同生活方式的脑血栓患者，血流动力学改变引发头疼的情况可能不同。例如，长期吸烟的男性脑血栓患者，其血管本身可能存在一定损伤，血流动力学改变相对更为明显，头疼的发生几率可能相对较高。
神经功能紊乱所致
脑血栓累及脑部的神经功能区域，会导致神经功能紊乱。脑部的神经负责调节头部的感觉等功能，当神经功能紊乱时，可能会出现异常的疼痛感觉，从而引发头疼。比如，若脑血栓影响了与头部感觉传导相关的神经通路，就可能使患者产生头疼症状。在有既往神经系统疾病病史的脑血栓患者中，神经功能紊乱引发头疼的可能性相对更大，因为其神经系统基础状态可能已经存在一定问题，更容易在脑血栓发生后出现神经功能的失调。
