基孔肯雅热的发病具有季节性。
伊蚊的繁殖和生长需要适宜的温度和充足的水源。雨季时，大量的积水为伊蚊提供了理想的繁殖场所，如废弃的轮胎、水桶、花盆等容易积水的容器。同时，温暖的气候条件加速了伊蚊的生长发育和病毒在其体内的繁殖速度。因此，在雨季和温暖季节，伊蚊数量大幅增加，基孔肯雅热的传播风险也随之上升，发病病例会显著增多。
在干燥寒冷的季节，水源减少，伊蚊的繁殖受到限制，其数量也会相应减少。而且低温会抑制伊蚊的活动能力和病毒的活性，使得病毒传播的机会降低。所以，在干燥寒冷时期，基孔肯雅热的发病情况通常较为少见。
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