扁平疣部分可能自行消失，这与免疫功能等有关，儿童青少年有一定自行消退几率但不绝对，成年人相对低，不良生活方式不利消退，有基础病史者更低，且扁平疣具传染性不应等待，长时间不消失或增多需就医，不同人群治疗有不同注意事项，可通过药物、物理等治疗干预。
从年龄因素来看，儿童和青少年相对而言免疫系统正在发育完善过程中，部分儿童扁平疣有一定自行消退几率，但也不能一概而论，若持续不消退也需要及时干预；成年人免疫系统相对稳定，自身消退的可能性相对儿童可能会低一些。从生活方式角度，生活作息不规律、长期处于压力大状态、过度劳累等会影响免疫系统功能，不利于扁平疣自行消退，而保持良好生活方式，如规律作息、适度运动等有助于增强免疫力，可能会促进扁平疣自行消退。对于有基础病史的人群，若本身患有免疫缺陷性疾病等，扁平疣自行消失的可能性更低，更需要积极就医处理。
不过，不建议等待扁平疣自行消失而不采取任何措施，因为扁平疣具有传染性，可能会自身接种传播导致皮疹增多，也可能传染给他人。如果扁平疣长时间没有自行消失或者有增多趋势等情况，应及时到皮肤科就诊，可通过药物治疗（如维A酸类药物等，但需遵医嘱）、物理治疗（如冷冻、激光等）等方法进行干预。对于特殊人群如孕妇，由于涉及特殊生理阶段，治疗需更加谨慎，一般会优先考虑对胎儿影响较小的治疗方式，且需要在医生充分评估利弊后进行选择；对于儿童患者，要更加注重治疗过程中的舒适感和安全性，遵循儿科安全护理原则来选择合适的治疗手段。
