细菌性痢疾的病原体是志贺菌属即痢疾杆菌，为革兰氏阴性杆菌，无鞭毛、荚膜、芽孢，分4个血清群，各群特点不同，通过粪-口途径传播，人群普遍易感，主要侵袭结肠黏膜致相关症状。
痢疾志贺菌（A群）：是毒力最强的一个菌群，可产生外毒素，包括神经毒素、细胞毒素和肠毒素，能引起严重的临床表现，如高热、剧烈腹痛、脓血便等，且易导致中毒性痢疾等严重并发症。
福氏志贺菌（B群）：在我国引起细菌性痢疾最常见的菌群，其感染易转为慢性，病程迁延，可能与福氏志贺菌能侵袭肠黏膜上皮细胞并形成持续感染有关，不同地区的流行菌株可能有所差异，在儿童和成年人群中均可引起发病，儿童感染后若未及时有效治疗，可能影响生长发育。
鲍氏志贺菌（C群）：较少见，其引起的痢疾症状轻重不一，有的类似轻型痢疾，有的可呈重型表现，在全球不同地区均有散发或局部流行情况，对于免疫力低下的人群，如老年人、艾滋病患者等，感染鲍氏志贺菌后更易出现病情加重或迁延不愈的情况。
宋内志贺菌（D群）：通常引起的症状相对较轻，多为轻型痢疾，表现为轻度腹泻、稀便等，但也可出现暴发流行，在儿童群体中较为常见，儿童感染宋内志贺菌后，若能及时诊断和治疗，预后一般较好，但仍需密切关注病情变化，防止发展为重型。志贺菌主要通过粪-口途径传播，被志贺菌污染的食物、水等是常见的传播媒介，人群普遍易感，尤其是儿童和老年人，儿童由于免疫系统发育尚未完善，对志贺菌的抵抗力相对较弱，老年人则可能因机体免疫力下降等因素更容易感染，且感染后病情可能相对较重，恢复时间较长。志贺菌侵入人体后，主要侵袭结肠黏膜，引起肠黏膜的炎症、溃疡等病变，导致腹泻、腹痛、黏液脓血便等典型的痢疾症状。
