长跖疣与长扁平疣无直接必然因果关系，主要由致病病毒亚型差异及个体免疫状态等多因素综合作用，跖疣由HPV-1型等亚型感染足底致角质性丘疹，扁平疣由HPV-3型等亚型感染头面手背致扁平状丘疹，人体免疫力状况影响对不同HPV亚型易感性，长跖疣不必然引发扁平疣，机体免疫低下等情况可能增加感染其他亚型风险但非绝对，儿童免疫不完善、成人有基础病史致免疫受影响时需留意皮肤变化但非长跖疣就一定长扁平疣。
一、致病病毒亚型差异决定初始发病表现不同
跖疣主要由人乳头瘤病毒（HPV）-1型等亚型感染足底皮肤引起，表现为足底出现角质性丘疹，表面粗糙，边界清晰；而扁平疣多由HPV-3型等亚型感染头面部、手背等部位皮肤引发，典型表现为皮肤出现扁平状丘疹，表面光滑。虽同属HPV感染，但不同亚型的病毒倾向侵袭不同部位皮肤，这是二者初始发病部位及形态不同的重要原因，所以长跖疣本身不会直接导致长扁平疣，因为致病的HPV亚型不同。
二、个体免疫状态对感染不同HPV亚型的影响
人体免疫力状况会影响对不同HPV亚型的易感性。一般来说，长了跖疣并不必然会引发扁平疣，然而当机体免疫力低下时，比如患有慢性疾病、长期使用免疫抑制剂等情况，可能会增加感染其他HPV亚型的风险，但这也不是绝对会导致同时或相继出现跖疣和扁平疣。例如儿童免疫系统尚不完善，相对更易受HPV感染，但也不一定感染跖疣后就会接着感染引发扁平疣；成人若本身有基础病史导致免疫功能受影响，需更留意皮肤变化，但这并非是长了跖疣就一定会长扁平疣的必然联系。总体而言，长跖疣与长扁平疣之间不存在直接的必然因果关系，主要由不同HPV亚型特性及个体免疫等多因素综合作用，而非长了跖疣就一定会出现扁平疣情况。
