肠胃炎急性发作期因机体应激、免疫力低下且身体虚弱，接种HPV疫苗可能加重不适或增加不良反应概率，故不建议接种；肠胃炎稳定期可由医生评估恢复情况等后谨慎决定是否接种；儿童群体患肠胃炎即使稳定接种也需医生严格评估耐受性；孕妇群体无论肠胃炎急性或稳定期接种均需谨慎，一般建议肠胃炎康复且孕期稳定经医生充分告知风险收益后再做接种决策。
一、肠胃炎急性发作期不建议接种HPV疫苗
当肠胃炎处于急性发作阶段，表现为剧烈腹泻、频繁呕吐、伴有发热等全身症状时，此时机体处于应激状态，免疫力相对低下且身体较为虚弱。接种HPV疫苗可能会加重身体不适症状，还可能增加疫苗不良反应发生的概率，如加重胃肠道不适反应等，所以急性发作期不建议接种HPV疫苗。
二、肠胃炎稳定期可评估后谨慎接种
若肠胃炎已处于稳定期，无明显的恶心、呕吐、腹泻等症状，身体整体状况较好，可由医生评估后再决定是否接种HPV疫苗。医生会综合考虑患者肠胃炎的恢复情况、当前身体一般状况等因素来判断接种的安全性和必要性。例如慢性肠胃炎患者经过治疗后病情稳定，没有急性发作的相关表现，在医生评估认为身体状态允许的情况下，可以安排接种HPV疫苗。
三、特殊人群需格外谨慎
（一）儿童群体
儿童的免疫系统和身体机能尚在发育中，若儿童患有肠胃炎，即使是处于相对稳定阶段，接种HPV疫苗时也需由医生严格评估。因为儿童对疫苗相关反应的耐受性与成人不同，需确保接种风险在可接受范围内。
（二）孕妇群体
孕妇属于特殊生理阶段，若孕妇患有肠胃炎，无论是急性还是稳定期，接种HPV疫苗都需谨慎。因为目前关于孕妇接种HPV疫苗对胎儿影响的相关研究有限，为了最大程度保障孕妇和胎儿的安全，一般会建议在肠胃炎康复且孕期稳定的情况下，经医生充分告知风险收益后再做接种决策。
