HPV为双链环状DNA病毒分多亚型，低危型引生殖器疣等良性病变，高危型持续感染与宫颈癌等恶性肿瘤相关；支原体是无细胞壁可独立生存的最小原核细胞型微生物，肺炎支原体致呼吸道感染，解脲脲原体等致泌尿生殖道感染，前者性接触等途径传播且女性等特定人群风险高，后者性活跃等人群感染风险增加。
HPV与支原体感染是完全不同的情况。
一、病原体本质不同1.HPV：人乳头瘤病毒（humanpapillomavirus,HPV），属于乳多空病毒科乳头瘤空泡病毒A属，是一种双链环状DNA病毒，有众多亚型，不同亚型致病表现不同，比如低危型HPV可引起生殖器疣等良性病变，高危型HPV持续感染与宫颈癌等恶性肿瘤的发生密切相关，这是通过大量分子生物学检测、流行病学调查等科学研究证实的，例如多项关于宫颈癌与HPV感染相关性的队列研究明确了高危HPV持续感染是宫颈癌发生的重要危险因素。2.支原体：是一类没有细胞壁、能独立生存的最小原核细胞型微生物，常见的如肺炎支原体主要引发呼吸道感染，解脲脲原体等可导致泌尿生殖道感染，其生物学特性、基因组成等与HPV有本质区别，通过微生物培养、核酸检测等方法可明确区分支原体感染。
二、致病及相关疾病不同1.HPV相关疾病：低危型HPV主要引起肛门生殖器部位的疣状病变，如尖锐湿疣，通过性接触等途径传播；高危型HPV持续感染可引起宫颈上皮内瘤变、宫颈癌等，在不同年龄、性别人群中均有影响，女性因生殖系统解剖结构特点更易受高危HPV感染影响，而有不洁性生活史、免疫功能低下等生活方式或病史的人群感染风险更高。2.支原体相关疾病：肺炎支原体感染主要表现为发热、咳嗽等呼吸道症状，好发于儿童及青少年等人群，解脲脲原体等引起泌尿生殖道感染时，可出现尿频、尿急、尿道分泌物等症状，性活跃人群、有不洁性行为史者感染风险增加。
