肠胃脂肪瘤形成与胚胎发育中原始间叶组织异常分化（不同年龄有差异）、脂肪代谢紊乱（长期高脂饮食等影响）、局部组织经慢性炎症等损伤修复时异常增生（不同年龄因炎症等风险不同）相关。
一、胚胎发育因素
在胚胎发育过程中，原始间叶组织的异常分化是肠胃脂肪瘤形成的潜在因素之一。胚胎时期间叶组织本应朝着特定的组织细胞类型进行分化，若出现分化异常，就可能使得脂肪组织在胃肠道黏膜下异常增生聚集，逐步形成脂肪瘤。不同年龄人群中，胚胎发育相关异常的发生概率存在差异，例如胎儿期若发生原始间叶组织分化异常，就可能为肠胃脂肪瘤的形成埋下隐患，而儿童时期胚胎发育已基本完成，但仍需考虑是否存在残留的发育异常情况。
二、脂肪代谢紊乱因素
当机体存在脂肪代谢相关的失衡状况时，易促使肠胃脂肪瘤形成。脂肪的合成、转运、分解等代谢途径若出现紊乱，会导致体内脂肪细胞的动态平衡被打破，过多的脂肪细胞有可能在肠胃部位异常沉积，进而逐渐形成脂肪瘤。在生活方式方面，长期高脂饮食的人群，摄入过多脂肪会加重脂肪代谢负担，增加脂肪代谢紊乱的风险，从而间接提升肠胃脂肪瘤的形成几率；不同年龄人群对高脂饮食导致脂肪代谢紊乱的易感性有所不同，一般而言，成年人长期高脂饮食更易引发脂肪代谢相关问题；性别因素目前虽无明确证据表明与脂肪代谢紊乱导致肠胃脂肪瘤形成有显著关联，但整体健康状况仍受性别相关内分泌等因素影响，可能间接作用于脂肪代谢。
三、局部组织损伤与修复因素
肠胃部位若经历慢性炎症、创伤等情况，局部组织在修复过程中可能出现脂肪组织的异常增生。例如，肠胃长期受到炎症刺激，炎症会损伤局部组织，机体启动修复机制，在修复过程中可能出现异常的脂肪组织增生，进而形成脂肪瘤。有肠胃慢性炎症病史的人群，由于其肠胃局部组织曾有损伤经历，修复过程中发生异常脂肪增生的几率相对更高；不同年龄人群因肠胃慢性炎症发生的频率和程度不同，其受局部组织损伤与修复异常影响形成肠胃脂肪瘤的风险也不同，比如中老年人群可能因肠胃黏膜退行性变等因素更易出现慢性炎症，从而增加相关风险。
