肠炎病毒感染病原体为病毒类，常急性起病有腹泻呕吐等自限性症状，可通过粪便病毒抗原或核酸检测，主要对症支持治疗；真菌感染病原体是真菌，腹泻可能持续久有黏液便等，免疫低下人群症状更隐匿严重，粪便镜检培养可确诊，需用抗真菌药，儿童是病毒高发人群需防脱水，免疫低下人群出现肠炎症状优先考虑真菌，老年要注意病情变化及抗真菌药使用需考虑肝肾功能等情况。
一、病原体差异
肠炎病毒感染的病原体主要为病毒类，如轮状病毒、诺如病毒等，此类病毒通过侵袭肠道上皮细胞引发炎症反应；而真菌感染的病原体是真菌，常见的有白色念珠菌等，真菌可在肠道内定植、繁殖并引起感染。
二、临床症状表现区别
病毒感染相关症状：肠炎病毒感染引起的肠炎常表现为急性起病，多有腹泻（呈水样便或稀便）、呕吐，部分患者可伴有发热，病程通常具有自限性，一般数天内可缓解，不同病毒感染症状细节略有差异，如轮状病毒感染多见于婴幼儿，常先有发热、呼吸道症状，随后出现腹泻；
真菌感染相关症状：真菌感染导致的肠炎腹泻症状可能持续时间较长，大便性状可能有变化，如出现黏液便，部分患者可能伴有口腔念珠菌感染表现（口腔黏膜白色斑膜等），且免疫低下人群（如长期使用广谱抗生素、免疫抑制剂者）感染真菌性肠炎时症状可能更隐匿或严重。
三、实验室检查差异
病毒感染检测：通过粪便病毒抗原检测或核酸检测可明确是否为病毒感染，例如诺如病毒可通过核酸扩增技术检测其核酸存在；
真菌感染检测：粪便真菌镜检可发现菌丝或孢子，粪便真菌培养能分离出致病真菌，通过这些检查手段可确诊真菌感染。
四、治疗原则区别
病毒感染治疗：主要是对症支持治疗，如纠正脱水、维持电解质平衡，一般无需使用抗病毒药物（特定病毒感染有针对性抗病毒药，但需严格遵循指南），依靠机体自身免疫清除病毒；
真菌感染治疗：需使用抗真菌药物，如氟康唑等，针对免疫低下等特殊人群需更谨慎评估并选择合适抗真菌方案。
五、特殊人群影响及注意事项
儿童群体：儿童是病毒感染性肠炎的高发人群，需重点关注补液预防脱水，而真菌感染在儿童中相对较少见，但长期使用抗生素的儿童易增加真菌感染风险，需监测大便情况；
免疫低下人群：如艾滋病患者、恶性肿瘤放化疗后患者等，真菌感染风险显著升高，此类人群出现肠炎症状时需优先考虑真菌感染可能，早期进行相关检查以明确诊断并及时干预；
老年人群：老年人体质较弱，无论是病毒还是真菌感染引起的肠炎，都要注意病情变化，及时就医评估，病毒感染时需关注基础疾病影响，真菌感染时抗真菌药物使用需考虑肝肾功能等情况。
