自然流产的原因复杂多样，主要可分为胚胎因素、母体因素、父亲因素和环境因素等。
1.胚胎因素
胚胎染色体异常是引起早期流产最常见的原因，约占50%-60%。染色体异常包括数目异常和结构异常，可能导致胚胎发育异常，无法正常生长，从而引发流产。
2.母体因素
全身性疾病如严重感染、高热、贫血、心力衰竭、慢性肝肾疾病等，可影响胚胎的着床和发育，导致流产；子宫畸形、子宫肌瘤、宫腔粘连等，会影响子宫腔的正常形态，不利于胚胎的生长发育，增加流产的风险。
3.父亲因素
精子染色体异常也可能导致胚胎染色体异常，从而引起流产。
4.环境因素
接触过多的放射线、化学物质（如甲醛、苯、铅等），以及吸烟、酗酒、滥用药物等不良生活习惯，都可能影响胚胎的发育，导致流产。
