霉菌性阴道炎主要由假丝酵母菌引起，其引起原因包括阴道内环境改变（激素水平变化使阴道内糖原增加、长期用广谱抗生素破坏菌群平衡，糖尿病、长期服避孕药致阴道pH值改变）、机体免疫力下降（全身性疾病致免疫低下、局部穿紧身化纤内裤、不注意卫生致局部免疫力降低）、外源感染（共用物品、接触污染衣物等接触感染源）
阴道内环境改变
激素水平变化：女性在孕期时，体内雌激素水平显著升高，雌激素能促进阴道上皮细胞糖原合成，使得阴道内糖原含量增加，为假丝酵母菌的生长提供了丰富的营养物质，从而容易引发霉菌性阴道炎；另外，长期应用广谱抗生素的女性，抗生素会抑制阴道内乳酸杆菌的生长，破坏了阴道内正常的菌群平衡，阴道内环境改变，假丝酵母菌就会大量繁殖，导致霉菌性阴道炎的发生。例如，有研究发现长期大量使用广谱抗生素的女性，霉菌性阴道炎的发生率明显高于未使用抗生素的女性。
阴道pH值改变：正常阴道内pH值维持在3.8~4.4之间，呈弱酸性环境，这种环境不利于假丝酵母菌生长。当女性患有糖尿病时，血糖升高会导致阴道内pH值改变，有利于假丝酵母菌生长繁殖，进而引发霉菌性阴道炎；另外，长期服用避孕药的女性，也可能会影响阴道内的pH值，增加霉菌性阴道炎的发病风险。
机体免疫力下降
全身性疾病影响：患有艾滋病等免疫系统疾病的女性，机体免疫力严重低下，对病原体的抵御能力减弱，假丝酵母菌容易趁机大量繁殖，引发霉菌性阴道炎；另外，长期使用免疫抑制剂的患者，如器官移植后服用免疫抑制剂的患者，其机体免疫力受到抑制，也容易患霉菌性阴道炎。
局部免疫力降低：一些局部因素也可能导致阴道局部免疫力降低，从而引发霉菌性阴道炎。比如，长期穿紧身化纤内裤，会使阴道局部温度和湿度增加，不利于阴道的透气，容易滋生假丝酵母菌；再者，不注意个人卫生，外阴清洁不到位，也会增加霉菌性阴道炎的发病几率。
外源感染
接触感染源：与患有霉菌性阴道炎的患者共用毛巾、浴盆等物品，可能会接触到假丝酵母菌而被感染；另外，接触被假丝酵母菌污染的衣物等，也有可能引起感染。例如，在公共浴室使用了被污染的毛巾，就有感染霉菌性阴道炎的风险。
