真菌可通过呼吸道吸入血行播散或在人体免疫功能异常时由体内条件致病性真菌侵袭中枢神经系统引发脑膜炎，免疫抑制患者如艾滋病及长期用免疫抑制剂者因免疫弱易感染，新生儿分娩时可能接触产道真菌增加风险，老年人因免疫衰退较青壮年更易发生真菌脑膜炎。
一、外源性真菌侵入途径
真菌可通过特定方式进入人体并侵袭中枢神经系统引发脑膜炎。例如曲霉菌可经呼吸道吸入后，通过血行播散途径到达中枢神经系统；隐球菌多经呼吸道吸入，随后经血循环播散至脑膜部位定植繁殖，从而引起隐球菌性脑膜炎等真菌性脑膜感染。
二、内源性条件致病性真菌侵袭
当人体免疫功能出现异常时，原本寄生于体内的条件致病性真菌可趁机侵袭中枢神经系统。例如长期使用广谱抗生素、糖皮质激素等药物，会破坏机体正常菌群平衡，导致念珠菌等条件致病菌大量增殖；艾滋病患者由于CD4T淋巴细胞计数显著降低，机体免疫防御功能严重受损，原本定植在口腔、肠道等部位的念珠菌、隐球菌等可侵入血流并累及脑膜，引发真菌脑膜炎。
三、特殊人群易感性差异
免疫抑制患者：如艾滋病患者因免疫系统遭严重破坏，隐球菌脑膜炎是其常见的机会性感染病症；长期使用免疫抑制剂的患者，其机体对真菌的抵御能力大幅下降，真菌更易侵袭中枢神经系统引发脑膜炎。
新生儿：新生儿免疫系统尚未完全发育成熟，在分娩过程中可能接触产道内的真菌，从而增加感染真菌脑膜炎的风险。
老年人：随着年龄增长，机体免疫功能逐渐衰退，对真菌的防御能力减弱，相较于青壮年，老年人发生真菌脑膜炎的几率相对更高。
