多囊卵巢综合征的发病与遗传、内分泌失调、生活方式、环境等因素有关，遗传具易感性，内分泌失调涉及下丘脑-垂体功能及胰岛素抵抗高胰岛素血症，生活方式有饮食不均衡、缺乏运动，环境有内分泌干扰物影响。
内分泌失调
下丘脑-垂体功能异常：下丘脑分泌的促性腺激素释放激素（GnRH）脉冲频率和振幅异常，会导致垂体分泌的促黄体生成素（LH）相对过多，促卵泡生成素（FSH）相对不足，LH/FSH比值升高。正常情况下，LH和FSH协同调节卵巢的卵泡发育和排卵等过程，而这种比值的异常会干扰卵巢的正常功能，影响卵泡的正常生长、发育及排卵，使得卵巢持续处于卵泡发育停滞状态，进而导致多囊卵巢的形成。
胰岛素抵抗与高胰岛素血症：多数多囊卵巢综合征患者存在胰岛素抵抗现象，即机体对胰岛素的敏感性降低。为了维持正常的血糖水平，胰腺会代偿性分泌更多胰岛素，从而出现高胰岛素血症。高胰岛素血症会通过多种途径影响卵巢功能，一方面刺激卵巢间质细胞分泌雄激素增加，导致高雄激素血症，表现为多毛、痤疮等；另一方面还会促进肝脏合成性激素结合球蛋白减少，使得游离雄激素水平升高，进一步加重内分泌紊乱，影响卵泡的正常发育。
生活方式因素
饮食不均衡：长期高热量、高脂肪、高糖的饮食习惯，会导致体重增加，而肥胖是多囊卵巢综合征的重要危险因素之一。肥胖可引起上述的胰岛素抵抗和内分泌失调等一系列改变，从而增加患病风险。例如，长期大量摄入高糖食物会使血糖波动较大，刺激胰岛素过度分泌，引发胰岛素抵抗等问题。
缺乏运动：运动量过少会影响机体的新陈代谢，导致脂肪堆积，同样容易引发胰岛素抵抗和内分泌失调，进而增加多囊卵巢综合征的发病几率。缺乏运动还可能影响下丘脑-垂体-卵巢轴的正常调节功能，使得激素分泌失衡。
环境因素
环境内分泌干扰物：长期暴露于一些环境内分泌干扰物中，如塑料制品中的邻苯二甲酸酯、农药中的滴滴涕等，这些物质可能会干扰人体内激素的正常合成、代谢和作用，影响下丘脑-垂体-卵巢轴的功能，从而增加多囊卵巢综合征的发病风险。例如，邻苯二甲酸酯可能通过模拟雌激素的作用或干扰激素受体功能等方式，干扰内分泌系统的正常调节。
