13价肺炎疫苗与23价肺炎疫苗在所含血清型种类、适用人群、接种程序和免疫效果特点上存在差异，13价主要针对6周龄-5岁儿童，含13种血清型，基础免疫4剂次等；23价适用于2岁以上高危人群等，含23种血清型，通常1剂次，2岁以下对其免疫效果不佳等。
1.疫苗所含肺炎球菌血清型种类不同
13价肺炎疫苗包含13种肺炎球菌血清型，主要针对儿童常见且致病力较强的血清型，如1、3、4、5、6A、6B、7F、9V、14、18C、19A、19F和23F等血清型。
23价肺炎疫苗包含23种肺炎球菌血清型，覆盖了更多种类的肺炎球菌血清型，但其中部分血清型在儿童中的致病性相对较弱。
2.适用人群有所差异
13价肺炎疫苗：主要适用于6周龄-5岁儿童。对于2岁以下的婴幼儿，由于其自身免疫系统尚不完善，接种13价肺炎疫苗能有效预防相关血清型肺炎球菌感染；对于2-5岁儿童，也可通过接种13价肺炎疫苗来进一步降低肺炎球菌感染风险。从年龄角度看，低龄儿童免疫系统发育不成熟，易受肺炎球菌侵袭，13价肺炎疫苗能提供针对性保护；生活方式方面，若低龄儿童有集体生活等情况，感染风险相对较高，接种13价肺炎疫苗可降低感染肺炎的几率。
23价肺炎疫苗：适用于2岁以上肺炎球菌性疾病高危人群及2岁以上患有慢性疾病（如心血管疾病、慢性肺病、糖尿病等）的人群、老年人等。对于2岁以上儿童，如果存在特殊病史，如患有某些慢性疾病等，可考虑接种23价肺炎疫苗；老年人随着年龄增长，免疫力下降，接种23价肺炎疫苗能预防相关血清型肺炎球菌感染；患有慢性疾病的人群，其身体抵抗力相对较弱，易被肺炎球菌感染，接种23价肺炎疫苗可降低患病风险。
3.接种程序有别
13价肺炎疫苗：基础免疫在2、4、6月龄进行，加强免疫在12-15月龄进行，共4剂次。对于6-12月龄未接种过13价肺炎疫苗的儿童，需接种3剂次，每剂间隔2个月；12-23月龄未接种过13价肺炎疫苗的儿童需接种2剂次，间隔2个月；24月龄-5岁未接种过13价肺炎疫苗的儿童接种1剂次。从年龄因素考虑，低龄儿童接种剂次和间隔有严格规定，是基于其免疫系统发育特点来制定，以确保疫苗能有效刺激机体产生免疫应答。
23价肺炎疫苗：通常只需接种1剂次，若存在需要再次接种的情况，一般建议在5年后再次接种。对于老年人等特殊人群，根据其健康状况和免疫情况来决定是否需要再次接种。
4.免疫效果特点不同
13价肺炎疫苗：对所包含血清型的肺炎球菌感染具有较好的预防作用，尤其是在低龄儿童中，能有效降低侵袭性肺炎球菌疾病的发生风险。研究表明，接种13价肺炎疫苗后，儿童体内针对相关血清型的抗体水平能显著升高，从而起到保护作用。从儿童年龄角度，低龄儿童接种后免疫应答相对较好，能有效抵御相应血清型肺炎球菌感染。
23价肺炎疫苗：虽然覆盖血清型多，但对于2岁以下儿童免疫效果不佳，因为2岁以下儿童免疫系统尚未成熟，接种23价肺炎疫苗后产生的免疫应答较弱。而对于2岁以上人群，接种后能诱导机体产生较持久的免疫应答，对所覆盖血清型的肺炎球菌感染有一定的预防作用，但由于其包含的部分血清型在儿童中致病性相对较低，所以对于儿童的保护作用相对13价肺炎疫苗有限。
