骨髓移植、干细胞移植（含外周血干细胞、脐带血干细胞）在细胞来源、采集过程、配型要求、适用疾病、并发症及特殊人群考虑等方面存在差异，骨髓移植细胞来源主要是骨髓造血干细胞，采集有创且恢复慢，配型要求严，用于血液系统恶性及非恶性等疾病，并发症有GVHD等；干细胞移植细胞来源更广泛，外周血干细胞采集相对轻松，脐带血干细胞免疫原性弱，配型要求相对宽松，外周血干细胞移植同骨髓移植应用于血液系统肿瘤，脐带血干细胞移植用于血液及先天性免疫缺陷病等，外周血干细胞移植有短期不良反应，脐带血干细胞移植并发症少但造血重建可能慢，儿童骨髓移植操作难恢复慢，脐带血干细胞移植适合儿童，老年患者移植需关注身体耐受性及全面评估。
一、细胞来源方面
1.骨髓移植的细胞来源主要是骨髓中的造血干细胞，需要通过骨髓穿刺等方法获取骨髓样本，其中造血干细胞的含量相对有限。例如，成人骨髓中造血干细胞的含量大约占有核细胞的0.5%-1%左右。
2.干细胞移植的细胞来源更为广泛，除了骨髓干细胞外，还包括外周血干细胞和脐带血干细胞等。外周血干细胞是通过注射粒细胞集落刺激因子等药物，使造血干细胞从骨髓释放到外周血中，然后通过血细胞分离机采集获得，其造血干细胞含量相对骨髓移植有所增加；脐带血干细胞则是从新生儿脐带和胎盘血液中获取，储存的脐带血中含有丰富的造血干细胞。
二、采集过程方面
1.骨髓移植的采集：需要在手术室或特定的操作室进行，采用局部麻醉或全身麻醉的方式，通过骨髓穿刺针抽取骨髓液，这个过程可能会给患者带来一定的疼痛和不适，并且采集后的恢复时间相对较长，一般需要数周时间来恢复骨髓穿刺部位的损伤。
2.干细胞移植的采集：外周血干细胞采集是在门诊或病房即可进行的操作，患者相对痛苦较小，采集过程一般需要数小时；脐带血干细胞采集则是在新生儿出生后非常短暂的时间内进行，对新生儿和产妇无不良影响，采集相对简便。
三、配型要求方面
1.骨髓移植：供者和受者之间的人类白细胞抗原（HLA）配型要求相对严格，因为骨髓中的免疫细胞成分较多，HLA配型不符容易导致严重的移植物抗宿主病（GVHD）等并发症。一般来说，同胞之间HLA配型完全相合的概率约为25%，非亲缘关系供者HLA配型完全相合的概率较低，约为几万分之一到几十万分之一。
2.干细胞移植：外周血干细胞移植和脐带血干细胞移植的HLA配型要求相对宽松一些。脐带血干细胞由于其免疫原性相对较弱，即使HLA配型不完全相合，发生严重GVHD的概率也相对较低；外周血干细胞移植的HLA配型要求介于骨髓移植和脐带血干细胞移植之间，但总体上比骨髓移植的配型要求相对宽泛。
四、适用疾病方面
1.骨髓移植：常用于治疗一些血液系统恶性肿瘤，如急性白血病、慢性粒细胞白血病等，也可用于治疗某些非恶性血液系统疾病，如重型再生障碍性贫血等。对于一些遗传性血液疾病，如地中海贫血等，骨髓移植也是重要的治疗手段之一。
2.干细胞移植：外周血干细胞移植在治疗血液系统恶性肿瘤方面与骨髓移植有相似的应用，如可以用于白血病的治疗；脐带血干细胞移植除了应用于血液系统疾病外，在一些先天性免疫缺陷病等疾病的治疗中也逐渐发挥重要作用，例如一些严重联合免疫缺陷病可以通过脐带血干细胞移植进行治疗。
五、并发症方面
1.骨髓移植：移植物抗宿主病是较为严重的并发症之一，根据发生的时间和严重程度可分为急性和慢性GVHD，急性GVHD多发生在移植后100天内，可累及皮肤、肝脏和肠道等，慢性GVHD则可能持续较长时间，影响多个器官功能；另外，骨髓移植后还可能出现感染、出血性膀胱炎等并发症。
2.干细胞移植：外周血干细胞移植的并发症与骨髓移植有一定相似性，但由于外周血干细胞采集过程中应用的粒细胞集落刺激因子等药物可能会带来一些短期的不良反应，如骨痛等；脐带血干细胞移植的并发症相对较少，尤其是严重GVHD的发生率较低，但可能存在造血重建相对缓慢等问题。
特殊人群考虑
对于儿童患者，骨髓移植的采集过程可能会因为儿童的配合度等问题增加操作难度，并且儿童在骨髓移植后恢复相对较慢，需要更加精心的护理；在配型方面，儿童如果是同胞间移植，HLA配型相合的概率相对固定，但非亲缘供者的选择需要更加谨慎。对于脐带血干细胞移植，儿童是较为适宜的人群，因为脐带血干细胞的免疫原性低，对于儿童患者发生GVHD的风险相对较低，并且脐带血干细胞的储存为儿童患者提供了便捷的供者来源选择。对于老年患者，无论是骨髓移植还是干细胞移植，都需要更加关注其身体的耐受性，因为老年患者的身体机能相对较弱，在采集过程中和移植后的并发症发生风险可能更高，需要在治疗前进行更全面的评估，包括心肺功能、肝肾功能等多方面的评估，以确定是否适合进行移植治疗以及选择合适的移植细胞来源等。
