生化妊娠原因包括胚胎染色体异常，母体存在内分泌（黄体、甲状腺、血糖异常）、免疫（自身免疫、同种免疫异常）、子宫（内膜病变、畸形）问题，环境接触有害物质或有不良生活方式，男方精子染色体异常，年龄较大、有既往不良妊娠史或患基础疾病者生化妊娠风险更高。
一、胚胎因素
染色体异常是导致早孕生化的重要原因，约50%~60%的生化妊娠与胚胎染色体数目或结构异常相关，异常的染色体无法支持胚胎正常发育，从而引发生化妊娠。
二、母体因素
（一）内分泌因素
1.黄体功能不全：黄体期孕激素分泌不足或黄体期缩短，会使子宫内膜容受性降低，不利于胚胎着床及发育，增加生化妊娠风险。
2.甲状腺功能异常：甲状腺功能减退或亢进均可干扰胚胎着床及发育过程，甲状腺激素水平失衡会影响胚胎的正常生长环境。
3.血糖异常：糖尿病患者若血糖控制不佳，高血糖环境会影响胚胎发育，进而易导致生化妊娠。
（二）免疫因素
1.自身免疫异常：存在抗磷脂抗体等自身抗体时，会影响胎盘血管形成，阻碍胚胎血供，不利于胚胎存活。
2.同种免疫异常：母体对胚胎免疫耐受不足，可引发免疫排斥反应，干扰胚胎正常着床与发育。
（三）子宫因素
1.子宫内膜病变：子宫内膜息肉、宫腔粘连等病变会改变子宫内膜形态与功能，影响胚胎着床。
2.子宫畸形：如纵隔子宫等子宫结构异常，会影响胚胎着床位置及发育环境，增加生化妊娠几率。
三、环境因素
接触过多有害物质，例如重金属、农药等化学物质，或长期处于高辐射环境中，可能干扰胚胎发育，导致生化妊娠；长期吸烟、酗酒、熬夜等不良生活方式，会干扰机体内分泌及代谢，提升生化妊娠发生风险。
四、男方因素
精子染色体异常可致使受精卵染色体异常，进而引发生化妊娠。
五、特殊人群情况
年龄较大女性：随年龄增长，卵子质量下降，染色体异常几率升高，生化妊娠风险相对更高。
有既往不良妊娠史者：既往有多次流产、生化妊娠等情况的女性，再次发生生化妊娠的风险增加。
患有基础疾病者：患有糖尿病、甲状腺疾病等基础疾病且病情控制不佳的女性，生化妊娠可能性增大。
