扁桃体癌恶性程度与病理分型相关，鳞状细胞癌高分化相对恶性低，低分化、未分化恶性高；临床分期早期局限恶性中等偏下，中晚期侵犯周围或转移恶性高；人群因素里老年患者免疫弱肿瘤进展具侵袭性，性别非核心决定因素，不良生活方式加速恶性进展，有头颈部癌前病变或免疫病史者肿瘤更易侵袭扩散。
一、病理分型相关恶性程度体现
扁桃体癌的病理类型以鳞状细胞癌最为常见，其中高分化鳞状细胞癌相对恶性程度稍低，细胞分化程度越低（如低分化、未分化鳞状细胞癌），恶性程度越高，这类癌细胞增殖、侵袭及转移能力更强。例如，研究显示低分化鳞状细胞癌相较于高分化者更容易出现早期颈部淋巴结转移等情况，提示其恶性程度相对更高。
二、临床分期对应的恶性程度
1.早期（Ⅰ、Ⅱ期）：此阶段肿瘤局限于扁桃体区域，未发生明显的远处转移及广泛的局部浸润，相对而言恶性程度在癌症范畴内处于中等偏下水平，但仍需积极治疗控制病情进展，因为若不及时干预，也可能向中晚期发展。
2.中晚期（Ⅲ、Ⅳ期）：Ⅲ期时肿瘤已侵犯周围组织，如邻近的咽旁间隙等，Ⅳ期可能出现颈部淋巴结转移甚至远处转移（如转移至肺、骨等部位），此时恶性程度明显升高，预后通常较差，因为肿瘤扩散范围广，治疗难度增大，患者生存时间等预后指标相对不佳，在所有癌症中属于恶性程度较高的情况，对患者健康威胁较大。
三、不同人群因素对扁桃体癌恶性程度体现的影响
1.年龄因素：老年患者身体机能衰退，免疫功能相对较弱，对于扁桃体癌导致的机体消耗等情况耐受能力差，可能使得肿瘤进展相对更具侵袭性，一定程度上会让扁桃体癌的恶性程度体现得更为突出，比如老年患者可能更快出现肿瘤相关的恶病质等情况。
2.性别因素：目前暂无明确证据表明性别差异会直接改变扁桃体癌本身的病理恶性程度，但在治疗耐受及预后方面可能有一定影响，例如女性患者在术后康复心理等方面可能有其自身特点，但这不是决定扁桃体癌恶性程度的核心因素，核心还是病理和分期等情况。
3.生活方式因素：有吸烟、酗酒等不良生活方式的患者，烟草中的致癌物质及酒精等会损伤机体黏膜等组织，促进癌细胞的发生发展，会加速扁桃体癌的恶性进展，使得原本的扁桃体癌在这类人群中恶性程度体现得更明显，如吸烟患者可能更易出现肿瘤的转移等情况。
4.病史因素：有头颈部其他相关癌前病变病史或免疫系统疾病病史的患者，其机体对于扁桃体癌的防御及肿瘤自身的进展情况不同，如有免疫系统缺陷的患者，肿瘤可能更容易侵袭扩散，从而让扁桃体癌的恶性程度相对更突出，因为机体自身抵御肿瘤的能力下降。
