慢性咽喉炎通常难以完全根治。
急性咽喉炎反复发作，可转为慢性。鼻腔、鼻窦的慢性炎症，其炎性分泌物倒流至咽喉部，长期刺激可引发慢性咽喉炎。另外，咽部邻近器官如扁桃体炎、腺样体肥大等，炎症蔓延也会导致慢性咽喉炎。还有，长期张口呼吸，空气未经鼻腔充分湿润、过滤，直接刺激咽喉部黏膜，易引起慢性炎症。如贫血、消化不良、胃食管反流病、心血管疾病、内分泌紊乱、自主神经功能失调、维生素缺乏以及免疫功能紊乱等全身性疾病，都可能影响咽部血液循环、营养供应或防御功能，从而引发慢性咽喉炎。而且这些全身性疾病往往较难完全治愈，也就导致慢性咽喉炎难以根治。
戒烟限酒，减少对咽喉部黏膜的刺激。对于长期用嗓的人群，如教师、歌手等，应注意正确发声，避免长时间过度用嗓，可通过学习科学发声方法，如腹式呼吸发声法等，减轻咽喉负担。同时，规律作息，保证充足睡眠，有助于提高机体免疫力，利于咽喉部黏膜的修复。
