窦性心律不齐可能是生理因素、自主神经功能紊乱、电解质紊乱、心肌炎、心肌梗死等原因引起的。
1.生理因素
生理因素引发的窦性心律不齐多为正常现象，常见于儿童和青少年，因心脏发育未成熟，神经调节功能不稳定所致；呼吸时胸腔压力变化影响心率，形成呼吸性窦性心律不齐；此外，剧烈运动、情绪波动、饮酒或喝咖啡等也可能暂时导致心律不齐，去除这些因素后通常可恢复正常。
2.自主神经功能紊乱
自主神经功能紊乱会打破交感神经和迷走神经的平衡，进而引发窦性心律不齐。当迷走神经张力过高时，会抑制心脏起搏功能，导致心率减慢且不规则；交感神经兴奋过度则可能使心率加快，同样可能造成心律不齐，长期精神紧张、焦虑、压力大、睡眠不足等是常见诱因。
3.电解质紊乱
电解质对维持心脏正常电生理活动意义重大，其紊乱易引发窦性心律不齐。低钾血症会改变心肌细胞静息电位，降低兴奋性并增高自律性；高钾血症则会抑制心肌传导功能，影响窦房结起搏；低镁血症、低钙血症等其他电解质紊乱，也可能通过干扰心肌细胞离子通道，破坏心脏正常节律。
4.心肌炎
心肌炎多由病毒、细菌、真菌等感染引起，炎症会直接损伤心肌细胞和心脏传导系统，影响窦房结的正常起搏与传导功能，从而导致窦性心律不齐。患者除心律不齐外，还可能出现发热、乏力、胸痛、心悸、呼吸困难等症状，严重时可危及生命。
5.心肌梗死
心肌梗死因冠状动脉供血急剧减少或中断，导致心肌严重缺血坏死，如果累及窦房结血液供应，会造成窦房结功能障碍，引发窦性心律不齐，可能表现为心率减慢或不规则。这是严重的心血管急症，常伴随剧烈胸痛、大汗、恶心、呕吐等症状，需及时救治。
