肛周脓肿主要由肛腺感染引发，肛腺开口于肛窦，肛窦易受侵袭致感染蔓延至肛腺引发发炎肿胀，感染可向上、向下、向外蔓延形成不同部位脓肿，同时免疫力低下、局部损伤等也是相关因素，免疫力低下时抵御细菌感染能力弱易发病，局部损伤会破坏防御屏障致细菌侵入引发感染。
一、肛腺感染的蔓延途径
向上蔓延：感染沿着肛腺导管向上蔓延，可累及直肠周围间隙，引发直肠后间隙脓肿等情况。比如，婴幼儿肛腺发育相对活跃，且肠道屏障功能较弱，更容易因肛窦感染导致肛腺感染向上蔓延引发肛周脓肿。
向下蔓延：感染向下可蔓延至肛周皮下组织，形成肛周皮下脓肿。对于一些长期便秘或腹泻的人群，肠道内环境不稳定，肛窦感染几率增加，更易出现感染向肛周皮下组织蔓延形成脓肿的情况。
向外蔓延：感染还可向肛周其他间隙扩散，累及坐骨直肠间隙等，形成相应间隙的脓肿。糖尿病患者由于机体免疫力相对较低，感染更容易向外扩散蔓延形成肛周脓肿，且病情可能相对更复杂，恢复时间可能更长。
二、其他相关因素
免疫力低下：当人体免疫力下降时，如长期患有慢性疾病（像艾滋病患者免疫力严重低下）、长期使用免疫抑制剂等情况，机体对细菌感染的抵御能力减弱，更容易遭受肛腺感染并发展为肛周脓肿。老年人由于身体机能衰退，免疫力也相对较低，相比年轻人更易发生肛周脓肿，且感染后恢复相对缓慢。
局部损伤：肛门部位受到外伤，如异物损伤、肛门指检时的过度操作等，可能会破坏肛门局部的防御屏障，使细菌更容易侵入肛腺引发感染。从事久坐、久站工作且肛门局部血液循环不畅的人群，局部损伤后更易发生感染形成肛周脓肿，因为血液循环不佳不利于感染的控制和组织修复。
