肛瘘不做手术会带来诸多不良后果，首先症状会持续加重，内口感染致脓性等分泌物流出刺激肛周皮肤，瘘管增多复杂化，外口时闭时溃致局部反复肿痛；其次长期不愈有癌变风险；还会影响肛门功能，可能导致肛门失禁；对特殊人群也有影响，儿童会影响生长发育及心理，老年人则因自身修复弱易使症状加重且合并基础疾病难控，增加并发症风险。
一、症状持续加重
肛瘘是肛管或直肠与肛周皮肤相通的肉芽肿性管道，由内口、瘘管、外口三部分组成。若不做手术，首先症状会持续加重。内口持续感染，会不断有脓性、血性分泌物从外口流出，刺激肛周皮肤，引起剧烈瘙痒，患者会忍不住搔抓，进一步加重皮肤破损，甚至可能引发感染扩散。而且瘘管会逐渐增多、复杂化，外口可时闭时溃，局部反复肿痛，影响患者的日常生活和工作，比如行走、坐立等都会受到明显影响。
二、癌变风险增加
虽然肛瘘癌变的几率相对较低，但长期不愈的肛瘘存在一定癌变风险。有研究表明，肛瘘患者发生肛管癌的可能性较正常人有所升高。由于肛瘘的慢性炎症刺激，反复的组织损伤和修复过程可能导致细胞异常增生，从而增加癌变的潜在可能。
三、影响肛门功能
随着病情的进展，肛瘘不做手术可能会影响肛门的正常功能。肛瘘的反复感染、炎症刺激会干扰肛门括约肌的正常收缩和舒张功能，长期下来可能导致肛门失禁等问题，表现为粪便不自主流出，严重影响患者的生活质量，给患者带来极大的心理负担和生活不便。
四、特殊人群的影响
儿童：儿童患有肛瘘若不及时手术，会影响其生长发育，因为长期的病痛折磨可能导致患儿营养吸收不良等情况，而且反复的肛周感染可能对儿童的心理发育也产生不良影响，比如因肛周不适而产生自卑、焦虑等情绪。
老年人：老年人身体机能下降，肛瘘不做手术时，其自身的修复能力较弱，症状可能更容易持续加重，而且可能会合并其他基础疾病，如糖尿病等，肛瘘的存在会使基础疾病控制更加困难，增加感染等并发症的发生风险，影响老年人的健康和生活自理能力。
