肛瘘治疗方法包括非手术治疗和手术治疗。非手术治疗有药物治疗（抗生素控制感染，难彻底治愈）和坐浴（改善血液循环、清洁局部、减轻炎症等）；手术治疗包括适用于低位肛瘘的瘘管切开术、多用于高位肛瘘的挂线疗法（避免肛门失禁）、适用于低位单纯性肛瘘的肛瘘切除术（切除瘘管及病变组织），不同年龄人群手术需注意相应特点。
一、非手术治疗
1.药物治疗：对于单纯性肛瘘的急性感染期等情况，可使用抗生素控制感染，但药物治疗一般难以彻底治愈肛瘘，多作为手术前后的辅助手段。例如，有研究表明在肛瘘急性炎症期使用合适的抗生素能暂时缓解红肿热痛等症状，但无法从根本上解决肛瘘内口、瘘管等问题。
2.坐浴：常用温水或中药制剂进行坐浴，可改善局部血液循环，保持局部清洁，减轻炎症反应，缓解疼痛等不适症状。一般每天可进行2-3次，每次15-20分钟，对于不同年龄、性别等人群均可适用，但要注意水温适宜，避免烫伤等情况，尤其是儿童皮肤娇嫩，需特别留意水温。
二、手术治疗
1.瘘管切开术：适用于低位肛瘘。手术将瘘管全部切开，靠肉芽组织生长使伤口愈合。该手术方式较为直接，能有效去除瘘管组织，但对于高位肛瘘不适用。对于儿童患者，由于其组织修复能力相对较强，术后恢复可能相对较快，但仍需密切观察伤口情况；对于老年患者，要考虑其身体状况对手术创伤的耐受程度等。
2.挂线疗法：多用于高位肛瘘。利用橡皮筋或有腐蚀作用的药线的机械性压迫作用，缓慢切开肛瘘。挂线疗法可避免一次性切断肛管直肠环造成肛门失禁，相对较为安全。在不同年龄人群中应用时需注意，儿童的肛管直肠环等组织发育尚不完善，操作时要更加精细；老年患者可能存在基础疾病等情况，需在手术前充分评估身体状况以确保手术安全。
3.肛瘘切除术：适用于低位单纯性肛瘘。将瘘管及其周围病变组织一并切除，创面直接缝合或开放。对于女性患者，要注意手术对会阴部外观等的影响；对于男性患者，也需关注手术对正常生理结构的影响以及术后恢复情况等。
