肛窦炎症状包括肛门疼痛（持续性轻度疼痛，排便加重，有放射痛，不同人群疼痛感受及相关影响不同）、肛门坠胀感（有下坠胀满感，便意频繁难排，久坐久站加重，不同人群坠胀感表现不同）、排便异常（便意频繁、排便量少，部分腹泻伴少量黏液）、分泌物增多（炎症致分泌物增多致肛门潮湿，糖尿病患者易出现）、局部体征（肛门指检可见肛窦等充血水肿、有脓性分泌物溢出、可摸到变硬肛窦，儿童指检需轻柔）。
肛门疼痛：是常见症状之一，一般为持续性的轻度疼痛，排便时由于粪便刺激发炎的肛窦，疼痛会加重，有的患者还可出现放射痛，疼痛可向臀部、会阴部等部位放射。不同年龄人群疼痛感受可能有差异，儿童由于表达能力相对较弱，可能会表现出哭闹不安等异常行为；成年女性在生理期时，盆腔充血可能会使肛门疼痛感觉相对更明显。生活方式方面，长期久坐、便秘等人群，肛门局部血液循环不畅，更容易引发疼痛且可能加重症状。有肛肠疾病病史的人群，肛窦炎复发时疼痛可能较首次发作更为敏感。
肛门坠胀感：患者常感觉肛门有下坠、胀满不适的感觉，总觉得有便意，但去排便时又排不出多少，这种坠胀感在久坐、久站后会加重。对于老年人，身体机能衰退，肛门周围组织的敏感性可能降低，但坠胀感可能持续存在且不易缓解；孕期女性由于子宫增大压迫盆腔，会加重肛门的坠胀感，需要特别关注。
排便异常：可出现便意频繁的情况，患者总是感觉肛门有东西刺激，想要去排便，但每次排便量少。部分患者还可能出现腹泻，粪便中可能带有少量黏液，这是因为炎症刺激肠道导致肠道功能紊乱。青少年由于生活节奏快、饮食不规律等，更容易出现排便异常的情况，需要养成良好的饮食和排便习惯来预防。
分泌物增多：炎症刺激肛隐窝，使其分泌物增多，这些分泌物可从肛门流出，导致肛门潮湿，患者会感觉肛门周围有潮湿不适的感觉，严重时可能会污染内裤。糖尿病患者由于血糖控制不佳，局部抵抗力下降，更容易出现分泌物增多的情况，需要严格控制血糖来辅助治疗肛窦炎。
局部体征：肛门指检时可发现肛窦、肛门瓣处有充血、水肿，按压时可有脓性分泌物从肛窦溢出，有的患者还可摸到变硬的肛窦。对于儿童进行肛门指检时，要注意操作轻柔，避免给儿童造成不必要的痛苦和损伤。
