非淋菌性尿道炎可对自身生殖系统直接损害，男性致附睾炎、前列腺炎，女性引发宫颈炎、盆腔炎；对生育功能有不良影响，男性致精子质量下降增不育风险，女性致输卵管炎症致不孕或宫外孕；可引发男性尿道狭窄、女性盆腔粘连等并发症；具传染性，可通过性接触传他人，孕妇感染可致新生儿患病。
一、对自身生殖系统的直接损害
非淋菌性尿道炎由沙眼衣原体、解脲支原体等病原体感染引起，男性患者可出现尿道分泌物增多、尿道瘙痒、刺痛等症状，若未及时有效治疗，可能进一步引发附睾炎，表现为附睾肿胀、疼痛、触痛等；还可能累及前列腺，导致前列腺炎，出现会阴部坠胀、疼痛，排尿异常等不适。女性患者感染后常引发宫颈炎，出现宫颈充血、水肿、分泌物增多等，若病情迁延，可波及盆腔，引发盆腔炎，表现为下腹部疼痛、腰骶部酸痛，部分患者可伴有发热等全身症状。
二、对生育功能的不良影响
男性生育：病原体感染可影响精子的生成、发育及活力，导致精子质量下降，如精子畸形率升高、活动力减弱等，进而增加男性不育的风险。同时，炎症波及附睾、前列腺等部位，可能干扰生殖系统的正常生理功能，影响生育能力。
女性生育：女性感染非淋菌性尿道炎后，病原体可上行感染至输卵管，引起输卵管炎症，导致输卵管黏膜充血、水肿、粘连，使输卵管管腔狭窄甚至堵塞，影响受精卵的正常运输，不仅可引发不孕，还会显著增加宫外孕的发生几率，对女性生育健康构成严重威胁。
三、引发的相关并发症
男性尿道狭窄：长期反复的非淋菌性尿道炎炎症刺激可导致尿道黏膜纤维化，逐渐引起尿道狭窄，表现为排尿困难、尿线变细等，严重时可影响正常排尿功能，给患者生活带来极大不便。
女性盆腔粘连：盆腔炎反复发作易导致盆腔内器官之间发生粘连，如子宫与输卵管、卵巢等粘连，这不仅会进一步加重盆腔疼痛等症状，还可能干扰生殖器官的正常解剖结构和功能，对生殖健康产生长期不良影响。
四、传染性及对他人的危害
非淋菌性尿道炎主要通过性接触传播，患者在与他人发生无保护性行为时，可将病原体传染给性伴侣，使其也感染该病，影响对方的生殖健康。同时，若孕妇感染非淋菌性尿道炎，还可能在分娩过程中传染给新生儿，导致新生儿出现结膜炎、肺炎等疾病，对新生儿健康造成严重损害。
